271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1402 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1402  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
525 aa  1083    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  40.38 
 
 
469 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  37.91 
 
 
470 aa  343  7e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.14 
 
 
543 aa  342  9e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.1 
 
 
540 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  39.14 
 
 
468 aa  336  5e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.78 
 
 
541 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 
525 aa  325  9e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  37.4 
 
 
465 aa  325  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  34.23 
 
 
468 aa  318  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  35.69 
 
 
524 aa  315  9e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  34.18 
 
 
467 aa  313  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 
570 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 
468 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  34.54 
 
 
522 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  35.69 
 
 
464 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 
470 aa  299  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.42 
 
 
474 aa  298  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  35.61 
 
 
469 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  33.97 
 
 
535 aa  297  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
465 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.53 
 
 
455 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  36.62 
 
 
465 aa  290  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  35.62 
 
 
467 aa  290  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.27 
 
 
465 aa  290  4e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.42 
 
 
469 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  33.14 
 
 
465 aa  290  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  34.54 
 
 
452 aa  289  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  35.78 
 
 
466 aa  289  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 
464 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 
467 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.55 
 
 
464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 
453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  35.11 
 
 
535 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.81 
 
 
525 aa  282  8.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.42 
 
 
530 aa  282  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 
476 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.86 
 
 
460 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
457 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
472 aa  279  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  34.03 
 
 
462 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 
452 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  34.03 
 
 
462 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.16 
 
 
536 aa  278  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 
451 aa  277  4e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  33.27 
 
 
462 aa  277  4e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 
462 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 
461 aa  276  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  35.2 
 
 
536 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  33.4 
 
 
470 aa  276  8e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 
544 aa  276  9e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.14 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  33.66 
 
 
460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.2 
 
 
452 aa  274  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 
536 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
468 aa  274  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  35.92 
 
 
484 aa  274  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  33.83 
 
 
467 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 
464 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  35.89 
 
 
532 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
463 aa  272  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 
452 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 
461 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  33.6 
 
 
455 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 
454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.77 
 
 
481 aa  270  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  32.58 
 
 
467 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  35.97 
 
 
542 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  31.87 
 
 
452 aa  266  8.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.83 
 
 
470 aa  266  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
489 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  31.87 
 
 
452 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  31.49 
 
 
452 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.95 
 
 
471 aa  265  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.3 
 
 
490 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  30.74 
 
 
476 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 
531 aa  265  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 
478 aa  264  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.14 
 
 
466 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 
452 aa  263  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 
452 aa  264  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  34.27 
 
 
480 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.27 
 
 
480 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.2 
 
 
466 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.26 
 
 
480 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 
455 aa  263  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 
454 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  31.88 
 
 
473 aa  262  8.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.06 
 
 
480 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.06 
 
 
480 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  34.13 
 
 
480 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  34.26 
 
 
478 aa  261  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  32.06 
 
 
454 aa  261  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5620  beta-lactamase domain protein  31.7 
 
 
473 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  33.59 
 
 
454 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  33.59 
 
 
454 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
470 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 
467 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  32.75 
 
 
536 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>