More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0193 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  52.51 
 
 		 635 aa  715    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  61.85 
 
 		 630 aa  838    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  56.54 
 
 		 636 aa  783    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  56.74 
 
 		 641 aa  760    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  51.57 
 
 		 635 aa  708    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  100 
 
 		 637 aa  1316    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  56.07 
 
 		 644 aa  772    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  54.98 
 
 		 644 aa  762    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  60.75 
 
 		 629 aa  804    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  55.25 
 
 		 647 aa  739    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  62.01 
 
 		 630 aa  842    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  51.25 
 
 		 635 aa  707    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  77.71 
 
 		 636 aa  1073    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  54.77 
 
 		 641 aa  756    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  53.13 
 
 		 640 aa  707    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  51.72 
 
 		 635 aa  709    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  51.72 
 
 		 635 aa  710    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  60.92 
 
 		 639 aa  828    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  52.12 
 
 		 634 aa  686    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  66.72 
 
 		 635 aa  934    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  47.71 
 
 		 642 aa  598  1e-169  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  47.24 
 
 		 635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  41.15 
 
 		 646 aa  520  1e-146  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  42.23 
 
 		 639 aa  515  1e-144  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  40.78 
 
 		 636 aa  501  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  39.97 
 
 		 640 aa  463  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  39.26 
 
 		 634 aa  456  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  38.74 
 
 		 634 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  38.12 
 
 		 635 aa  451  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  36.94 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  34.82 
 
 		 422 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  34.82 
 
 		 422 aa  262  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 		 422 aa  258  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  35.81 
 
 		 421 aa  252  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.6 
 
 		 536 aa  223  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  32.75 
 
 		 830 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  31 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  30.11 
 
 		 535 aa  219  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  32.31 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.26 
 
 		 460 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  33.06 
 
 		 470 aa  216  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 		 432 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.03 
 
 		 541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.93 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.54 
 
 		 540 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 		 468 aa  214  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 		 525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  32.42 
 
 		 468 aa  213  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  32.05 
 
 		 452 aa  213  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 		 433 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 		 453 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  36.11 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 536 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  35.65 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  32.97 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 524 aa  211  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.54 
 
 		 543 aa  210  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  29.36 
 
 		 469 aa  210  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.2 
 
 		 474 aa  208  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 		 531 aa  209  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 		 455 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 		 547 aa  208  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  29.3 
 
 		 468 aa  207  4e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 		 461 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 		 536 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  28.66 
 
 		 467 aa  206  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 454 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.91 
 
 		 465 aa  205  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 454 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  29.98 
 
 		 821 aa  204  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  30.79 
 
 		 452 aa  204  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  32.2 
 
 		 468 aa  204  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 		 522 aa  204  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 		 465 aa  204  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 455 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  32.75 
 
 		 452 aa  203  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 		 464 aa  203  8e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.55 
 
 		 467 aa  203  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  31.02 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  31.14 
 
 		 470 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.66 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 		 477 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  29.89 
 
 		 467 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.02 
 
 		 469 aa  201  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  30.84 
 
 		 476 aa  201  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.63 
 
 		 460 aa  201  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 465 aa  201  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  29.78 
 
 		 441 aa  200  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 536 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  29.89 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  30.47 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.44 
 
 		 466 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.32 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>