More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0197 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
422 aa  867    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  87.89 
 
 
421 aa  761    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  72.07 
 
 
426 aa  663    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  98.34 
 
 
422 aa  855    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  98.34 
 
 
422 aa  855    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
635 aa  288  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 
646 aa  276  6e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 
635 aa  270  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  37.47 
 
 
642 aa  270  2.9999999999999997e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  37.38 
 
 
635 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  35.84 
 
 
635 aa  268  1e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  34.55 
 
 
636 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 
630 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 
640 aa  262  8e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  34.14 
 
 
647 aa  262  8.999999999999999e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 
634 aa  260  3e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  34.22 
 
 
635 aa  259  9e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 
634 aa  257  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  34.38 
 
 
637 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 
639 aa  257  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 
635 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
630 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  33.94 
 
 
629 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  34.61 
 
 
635 aa  253  7e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  34.61 
 
 
635 aa  252  7e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 
636 aa  250  4e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 
636 aa  249  6e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  34.08 
 
 
640 aa  249  9e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  32.74 
 
 
644 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 
639 aa  240  4e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  32.07 
 
 
644 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 
641 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  35.47 
 
 
433 aa  232  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
641 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 
433 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 
433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  33.74 
 
 
433 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  33.57 
 
 
411 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 
432 aa  216  5e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 
634 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 
460 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  31.63 
 
 
767 aa  202  8e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.26 
 
 
543 aa  202  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  33.33 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 
821 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.05 
 
 
540 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 
429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.7 
 
 
410 aa  195  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
411 aa  193  5e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  29.26 
 
 
455 aa  193  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  31.41 
 
 
411 aa  193  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  31.57 
 
 
425 aa  192  9e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 
414 aa  190  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31 
 
 
432 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 
452 aa  190  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 
461 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 
425 aa  189  8e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 
830 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
422 aa  188  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 
466 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  29.62 
 
 
793 aa  187  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 
421 aa  188  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.15 
 
 
536 aa  186  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.34 
 
 
541 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  28.13 
 
 
468 aa  182  7e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  28.1 
 
 
467 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  28.54 
 
 
468 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02710  hypothetical protein  30.62 
 
 
773 aa  180  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 
465 aa  180  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  29.01 
 
 
469 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  30.31 
 
 
441 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  32.92 
 
 
430 aa  180  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  28.47 
 
 
452 aa  179  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 
464 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.87 
 
 
467 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 
468 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  28.23 
 
 
602 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  28.11 
 
 
455 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 
455 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.76 
 
 
455 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  28.15 
 
 
884 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  29.21 
 
 
485 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
453 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  28.67 
 
 
452 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  27.23 
 
 
452 aa  176  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
525 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  27.51 
 
 
460 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 
455 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.96 
 
 
460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.68 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  28.98 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 
468 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  28.82 
 
 
470 aa  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>