More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02710 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH02710  hypothetical protein  100 
 
 
773 aa  1613    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  39.61 
 
 
884 aa  572  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  42.59 
 
 
767 aa  493  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  48.57 
 
 
793 aa  483  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  41.57 
 
 
602 aa  473  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 
642 aa  191  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  29.03 
 
 
635 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 
635 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 
640 aa  181  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 
422 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
422 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 
635 aa  179  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 
422 aa  179  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 
634 aa  178  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 
635 aa  178  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 
426 aa  178  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 
639 aa  177  8e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 
635 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 
635 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
821 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 
635 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 
421 aa  173  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 
636 aa  170  9e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
830 aa  161  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
634 aa  160  6e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 
640 aa  156  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  25.35 
 
 
647 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 
646 aa  154  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  27.53 
 
 
636 aa  148  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.63 
 
 
636 aa  147  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 
635 aa  146  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  25.73 
 
 
455 aa  144  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 
461 aa  144  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  25.46 
 
 
644 aa  143  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
536 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 
468 aa  143  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  27.61 
 
 
637 aa  142  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
630 aa  142  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 
639 aa  142  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  26.21 
 
 
589 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 
630 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 
603 aa  141  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  24.78 
 
 
472 aa  141  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
459 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 
472 aa  140  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  24.56 
 
 
472 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  24.56 
 
 
472 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  24.56 
 
 
472 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 
452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  25.06 
 
 
447 aa  138  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  24.33 
 
 
644 aa  137  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 
641 aa  137  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  24.27 
 
 
536 aa  137  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
456 aa  136  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.21 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  26.59 
 
 
452 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
433 aa  135  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 
461 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  25.36 
 
 
641 aa  134  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.61 
 
 
543 aa  134  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  24.73 
 
 
469 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1566  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 
441 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0665026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.38 
 
 
541 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.72 
 
 
460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 
460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  25.66 
 
 
470 aa  129  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  26.36 
 
 
464 aa  128  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.89 
 
 
454 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  24.33 
 
 
467 aa  127  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.51 
 
 
450 aa  127  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 
634 aa  127  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  24.67 
 
 
454 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  24.38 
 
 
468 aa  127  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 
460 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 
457 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  23.99 
 
 
470 aa  125  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 
454 aa  125  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2131  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 
464 aa  125  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  23.24 
 
 
540 aa  124  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  25.16 
 
 
433 aa  124  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  22.71 
 
 
535 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  25.05 
 
 
477 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  24.18 
 
 
525 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  25.16 
 
 
485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 
466 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  25.18 
 
 
453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5620  beta-lactamase domain protein  25.72 
 
 
473 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 
465 aa  122  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  23.32 
 
 
464 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  24.43 
 
 
421 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  24.73 
 
 
433 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  25.66 
 
 
542 aa  120  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2716  beta-lactamase domain protein  24.95 
 
 
481 aa  120  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.521064 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 
422 aa  120  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  24.94 
 
 
468 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  25.73 
 
 
452 aa  120  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  24.95 
 
 
433 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  25.78 
 
 
460 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  23.52 
 
 
531 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  25.06 
 
 
462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>