More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2131 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2131  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 464 aa  929    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 		 456 aa  303  5.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3180  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 		 452 aa  216  9e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 		 821 aa  189  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 		 830 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  26.91 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 		 635 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  26.13 
 
 		 602 aa  140  7e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  28 
 
 		 767 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  23.54 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  25.8 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 642 aa  136  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 634 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  24.69 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  25.97 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  30.43 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 577 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  26.72 
 
 		 635 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  27.2 
 
 		 640 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  28.34 
 
 		 397 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  27.04 
 
 		 813 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 640 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.26 
 
 		 541 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 		 422 aa  130  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 536 aa  130  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  27.21 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 667 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02710  hypothetical protein  24.79 
 
 		 773 aa  127  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 		 639 aa  127  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 		 461 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  26.24 
 
 		 468 aa  126  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 522 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 		 634 aa  124  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  27.74 
 
 		 636 aa  124  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  28.39 
 
 		 468 aa  124  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 		 461 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  27.65 
 
 		 647 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1402  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 525 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2716  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.521064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  28.54 
 
 		 652 aa  120  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.94 
 
 		 543 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  25.45 
 
 		 411 aa  119  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.05 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  24.94 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  26.86 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.26 
 
 		 465 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2642  hypothetical protein  28.13 
 
 		 455 aa  118  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.35 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 		 635 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 		 630 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.01 
 
 		 532 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  26.61 
 
 		 476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 		 425 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  26.36 
 
 		 536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 639 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 		 635 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 		 464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 		 635 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 		 635 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  24.95 
 
 		 467 aa  113  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 		 525 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 		 547 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 411 aa  113  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  26.61 
 
 		 637 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 630 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  25.05 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  28.4 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  27.33 
 
 		 629 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0797  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.66 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 		 646 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  24.51 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 635 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  23.61 
 
 		 793 aa  110  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  25.53 
 
 		 884 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  25.59 
 
 		 636 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  25.39 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  27.58 
 
 		 532 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  24.85 
 
 		 570 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>