More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3180 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3180  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 452 aa  923    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  37.53 
 
 		 456 aa  303  6.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2131  beta-lactamase domain protein  31.81 
 
 		 464 aa  209  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  29.16 
 
 		 830 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 		 821 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  27.04 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 		 577 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.67 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 667 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 		 636 aa  140  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.32 
 
 		 636 aa  140  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  27.6 
 
 		 473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  27.47 
 
 		 635 aa  136  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  28.76 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 		 470 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  27.91 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 467 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  25.93 
 
 		 647 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  26.26 
 
 		 468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 		 455 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 		 635 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  29 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 		 642 aa  128  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  27.13 
 
 		 602 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 640 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.71 
 
 		 541 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  28.08 
 
 		 455 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.02 
 
 		 543 aa  127  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 		 455 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  26.65 
 
 		 635 aa  126  9e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  26.65 
 
 		 635 aa  126  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  28.04 
 
 		 472 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  29.3 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  28.04 
 
 		 472 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  28.04 
 
 		 472 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  24.38 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  28.04 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  24.94 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  28.1 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.5 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 		 639 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  23.69 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  25.18 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 		 634 aa  124  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  28.04 
 
 		 603 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  23.43 
 
 		 432 aa  124  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 421 aa  124  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  24.7 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  25.05 
 
 		 640 aa  122  9e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 635 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 		 652 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 		 635 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  25.22 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  25.67 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 		 635 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  23.21 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  26.55 
 
 		 452 aa  120  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  24.68 
 
 		 452 aa  120  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 		 630 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  27.09 
 
 		 452 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 		 635 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 639 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  26.43 
 
 		 636 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 570 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  26.93 
 
 		 813 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  23.91 
 
 		 470 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  25.37 
 
 		 629 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  26.56 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  26.36 
 
 		 452 aa  117  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 		 433 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 		 630 aa  117  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  27.57 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.35 
 
 		 467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.22 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.85 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  25.24 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  24.06 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  23.82 
 
 		 644 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  27.84 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.91 
 
 		 530 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  24.56 
 
 		 634 aa  112  9e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  25.23 
 
 		 476 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  24.89 
 
 		 637 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  31.58 
 
 		 884 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 		 461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>