More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0930 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  100 
 
 
410 aa  839    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  41.99 
 
 
411 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 
425 aa  270  4e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 
425 aa  270  5e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  37.83 
 
 
414 aa  265  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  35.97 
 
 
428 aa  257  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  37.05 
 
 
430 aa  257  2e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  36.17 
 
 
411 aa  256  4e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  37.56 
 
 
397 aa  256  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  35.46 
 
 
429 aa  255  8e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.05 
 
 
432 aa  253  5.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  36.05 
 
 
432 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  34.28 
 
 
421 aa  250  3e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  35.78 
 
 
422 aa  248  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 
411 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 
428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  37.15 
 
 
433 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  36.41 
 
 
433 aa  236  7e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  36.64 
 
 
433 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
422 aa  229  5e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 
421 aa  218  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 
635 aa  203  6e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  31.32 
 
 
635 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  31.32 
 
 
635 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
635 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 
635 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  32.79 
 
 
635 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  32.05 
 
 
821 aa  196  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  31.7 
 
 
422 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  31.92 
 
 
629 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  32.31 
 
 
644 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 
422 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  34.76 
 
 
635 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 
422 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  30.02 
 
 
647 aa  189  7e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.66 
 
 
644 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 
639 aa  187  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  29.98 
 
 
421 aa  187  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 
641 aa  186  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 
642 aa  184  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  31.24 
 
 
637 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 
641 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 
640 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 
634 aa  182  7e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 
640 aa  182  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 
635 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 
577 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 
630 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 
630 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 
634 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 
830 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  31.62 
 
 
636 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 
634 aa  170  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
646 aa  170  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.51 
 
 
636 aa  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 
636 aa  168  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 
426 aa  168  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.88 
 
 
467 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  28.3 
 
 
467 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  28.27 
 
 
467 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
468 aa  160  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 
525 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.03 
 
 
540 aa  159  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.53 
 
 
541 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.66 
 
 
543 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 
451 aa  157  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
639 aa  157  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  27.09 
 
 
767 aa  156  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 
524 aa  156  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  30.93 
 
 
441 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 
454 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  28.2 
 
 
476 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  29.36 
 
 
452 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  27.32 
 
 
602 aa  153  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.6 
 
 
470 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 
531 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  27.54 
 
 
455 aa  151  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 
467 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.69 
 
 
466 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  30.99 
 
 
667 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  27.69 
 
 
454 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  29.09 
 
 
453 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 
536 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  29.58 
 
 
473 aa  149  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1843  metallo-beta-lactamase family protein  28.27 
 
 
475 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100473  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  27.52 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  27.06 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.83 
 
 
530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  26.85 
 
 
884 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 
652 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  26.68 
 
 
793 aa  147  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 
447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.67 
 
 
536 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2642  hypothetical protein  29.81 
 
 
455 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 
536 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
455 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  28.73 
 
 
455 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 
460 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.75 
 
 
454 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>