More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2642 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2642  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  934    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  63.96 
 
 		 441 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0265  putative metallo-beta-lactamase  57.89 
 
 		 484 aa  568  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1417  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.01 
 
 		 502 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2820  beta-lactamase domain-containing protein  41.96 
 
 		 521 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1843  metallo-beta-lactamase family protein  47.26 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1856  beta-lactamase domain-containing protein  44.89 
 
 		 488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.510486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2610  beta-lactamase domain-containing protein  45.97 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0355734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2962  beta-lactamase domain-containing protein  41.06 
 
 		 526 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29569  normal  0.463279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15900  metallo-beta-lactamase family protein  48.38 
 
 		 510 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1753  hypothetical protein  44.96 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1343  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.44 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0797  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.13 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1382  beta-lactamase domain-containing protein  45.63 
 
 		 482 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.04 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1488  exonuclease  42.44 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000935929  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3639  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.29 
 
 		 480 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3287  beta-lactamase domain protein  45.85 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1775  beta-lactamase domain protein  44.39 
 
 		 477 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.164082  normal  0.0243284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1367  beta-lactamase domain-containing protein  44.59 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3939  beta-lactamase domain-containing protein  44.37 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.187647 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2114  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  43.1 
 
 		 486 aa  360  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.11 
 
 		 543 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.37 
 
 		 540 aa  279  6e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.64 
 
 		 541 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  36.53 
 
 		 462 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  37.47 
 
 		 462 aa  266  7e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  35.7 
 
 		 531 aa  264  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 		 522 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  36.06 
 
 		 465 aa  260  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 		 525 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.39 
 
 		 490 aa  260  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.87 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  36.69 
 
 		 477 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  36.8 
 
 		 469 aa  257  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.83 
 
 		 455 aa  256  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 		 465 aa  256  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.28 
 
 		 470 aa  256  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.51 
 
 		 530 aa  256  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.46 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 		 464 aa  254  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  36.8 
 
 		 470 aa  254  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.58 
 
 		 464 aa  253  6e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.75 
 
 		 490 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  35.38 
 
 		 469 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  34.92 
 
 		 462 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  34.92 
 
 		 462 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  36.4 
 
 		 484 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.65 
 
 		 467 aa  250  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  35.31 
 
 		 570 aa  250  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 		 468 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 547 aa  249  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  33.84 
 
 		 467 aa  249  6e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  35.84 
 
 		 465 aa  249  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 		 464 aa  249  7e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.44 
 
 		 481 aa  249  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  37.86 
 
 		 480 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.86 
 
 		 480 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  33.05 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  33.71 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  37.78 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  34.66 
 
 		 544 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  36.12 
 
 		 463 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 		 478 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 		 489 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  38.14 
 
 		 478 aa  247  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  33.79 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  37.42 
 
 		 480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  36.41 
 
 		 457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.71 
 
 		 474 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 		 467 aa  242  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  34.15 
 
 		 465 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  36.7 
 
 		 478 aa  242  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  35.27 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  35.11 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.93 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  35.18 
 
 		 455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  33.93 
 
 		 468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1602  beta-lactamase-like  36.3 
 
 		 535 aa  240  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.49 
 
 		 536 aa  239  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  34.87 
 
 		 455 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  35.96 
 
 		 452 aa  239  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 		 524 aa  239  9e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 		 476 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 		 535 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  36.26 
 
 		 540 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.97 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.97 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.97 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  32.4 
 
 		 536 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.46 
 
 		 466 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 		 536 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  34.61 
 
 		 470 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 		 452 aa  236  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  36.47 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  36.4 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  34.86 
 
 		 535 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>