More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0265 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0265  putative metallo-beta-lactamase  100 
 
 		 484 aa  999    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  60.78 
 
 		 441 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2642  hypothetical protein  57.89 
 
 		 455 aa  568  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1843  metallo-beta-lactamase family protein  44.8 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1343  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.79 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2820  beta-lactamase domain-containing protein  45.45 
 
 		 521 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1417  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.63 
 
 		 502 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2610  beta-lactamase domain-containing protein  45.77 
 
 		 473 aa  428  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0355734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1488  exonuclease  43.17 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000935929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1856  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 		 488 aa  415  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.510486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0797  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.57 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3287  beta-lactamase domain protein  44 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2962  beta-lactamase domain-containing protein  40.77 
 
 		 526 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29569  normal  0.463279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1775  beta-lactamase domain protein  41.19 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.164082  normal  0.0243284 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.26 
 
 		 460 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15900  metallo-beta-lactamase family protein  42.18 
 
 		 510 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1753  hypothetical protein  42.07 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1382  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 		 482 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3639  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.85 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2114  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  44.03 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3939  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 		 476 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.187647 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1367  beta-lactamase domain-containing protein  40.46 
 
 		 477 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267628 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.81 
 
 		 465 aa  264  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.81 
 
 		 540 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.34 
 
 		 471 aa  256  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.81 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  33.4 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  36.81 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.88 
 
 		 543 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.97 
 
 		 467 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  37.21 
 
 		 484 aa  254  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.62 
 
 		 541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  34.81 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 		 462 aa  252  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.66 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  35.7 
 
 		 465 aa  250  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.87 
 
 		 490 aa  250  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  34.81 
 
 		 451 aa  250  5e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.79 
 
 		 530 aa  249  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 		 463 aa  249  8e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  33.26 
 
 		 515 aa  249  9e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  32.69 
 
 		 468 aa  249  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.4 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  33.62 
 
 		 468 aa  247  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  33.06 
 
 		 477 aa  246  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.63 
 
 		 455 aa  246  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 		 536 aa  246  9e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  34.56 
 
 		 535 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  33.55 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  34.96 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.44 
 
 		 536 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.33 
 
 		 464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 		 462 aa  243  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  33.12 
 
 		 462 aa  243  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  33.26 
 
 		 522 aa  243  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 		 489 aa  242  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  32.07 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  33.91 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 		 465 aa  240  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 		 468 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  34.33 
 
 		 469 aa  240  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  31.86 
 
 		 469 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 		 457 aa  239  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  33.55 
 
 		 603 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 531 aa  238  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 472 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 		 570 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  33.62 
 
 		 525 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.68 
 
 		 481 aa  237  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.71 
 
 		 480 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.71 
 
 		 480 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.93 
 
 		 450 aa  236  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  33.06 
 
 		 465 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.02 
 
 		 480 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  31.29 
 
 		 544 aa  236  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 		 476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 536 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.64 
 
 		 525 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  33.12 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.72 
 
 		 460 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  32.92 
 
 		 467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  32.64 
 
 		 589 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  33.61 
 
 		 454 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  33.61 
 
 		 454 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 		 536 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.8 
 
 		 466 aa  232  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  33.61 
 
 		 455 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  35.11 
 
 		 478 aa  231  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>