275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3639 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1753  hypothetical protein  84.58 
 
 		 480 aa  840    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3639  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  100 
 
 		 480 aa  987    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1856  beta-lactamase domain-containing protein  57.67 
 
 		 488 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.510486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15900  metallo-beta-lactamase family protein  60.29 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1382  beta-lactamase domain-containing protein  57.2 
 
 		 482 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1775  beta-lactamase domain protein  57.02 
 
 		 477 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.164082  normal  0.0243284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3939  beta-lactamase domain-containing protein  58.17 
 
 		 476 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.187647 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1367  beta-lactamase domain-containing protein  56.61 
 
 		 477 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  53.18 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3287  beta-lactamase domain protein  55.24 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2610  beta-lactamase domain-containing protein  53.03 
 
 		 473 aa  482  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0355734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1488  exonuclease  48.38 
 
 		 500 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000935929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0797  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.8 
 
 		 477 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2114  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  46.8 
 
 		 486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1843  metallo-beta-lactamase family protein  48.36 
 
 		 475 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2962  beta-lactamase domain-containing protein  46.64 
 
 		 526 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29569  normal  0.463279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1343  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.39 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1417  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.84 
 
 		 502 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2820  beta-lactamase domain-containing protein  43.1 
 
 		 521 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  45.42 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0265  putative metallo-beta-lactamase  40.65 
 
 		 484 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2642  hypothetical protein  43.29 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  35.76 
 
 		 463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 		 465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.17 
 
 		 541 aa  239  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  34.43 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.45 
 
 		 465 aa  236  8e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  35.36 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  34.58 
 
 		 536 aa  233  6e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  34.09 
 
 		 462 aa  233  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 515 aa  232  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  35.99 
 
 		 467 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  30.59 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  32.52 
 
 		 535 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  33.75 
 
 		 468 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  32.15 
 
 		 447 aa  229  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  34.16 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  34.45 
 
 		 484 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 		 547 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 		 522 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 		 524 aa  224  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.6 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 		 451 aa  221  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  31.81 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 535 aa  220  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.96 
 
 		 543 aa  219  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  33.96 
 
 		 478 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.16 
 
 		 480 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  33.13 
 
 		 480 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.57 
 
 		 467 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.85 
 
 		 480 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.85 
 
 		 480 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  33.13 
 
 		 480 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.13 
 
 		 480 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 		 544 aa  216  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  29.98 
 
 		 464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  33.13 
 
 		 457 aa  216  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  33.75 
 
 		 467 aa  216  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 		 489 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  32.93 
 
 		 478 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  29.65 
 
 		 467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  32.34 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 		 525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.1 
 
 		 490 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  32.92 
 
 		 469 aa  213  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.44 
 
 		 481 aa  213  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.59 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  31.93 
 
 		 531 aa  212  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.43 
 
 		 530 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  33.54 
 
 		 470 aa  210  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.34 
 
 		 540 aa  210  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 		 465 aa  209  6e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  33.96 
 
 		 485 aa  209  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 		 536 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.99 
 
 		 490 aa  209  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 536 aa  209  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.56 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  31.95 
 
 		 462 aa  206  7e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.9 
 
 		 525 aa  205  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 		 465 aa  204  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.79 
 
 		 466 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 		 453 aa  203  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.56 
 
 		 536 aa  202  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.4 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  31.45 
 
 		 452 aa  200  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 461 aa  200  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 		 464 aa  199  9e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 		 467 aa  199  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 		 468 aa  199  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  27.8 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 		 462 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  31.11 
 
 		 462 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 467 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  32.78 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 		 454 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>