More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1727 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
646 aa  1342    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  45.3 
 
 
635 aa  549  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  45.71 
 
 
635 aa  548  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  45.25 
 
 
642 aa  543  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  43.68 
 
 
636 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  42.63 
 
 
635 aa  533  1e-150  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 
635 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  42.16 
 
 
635 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  40.75 
 
 
644 aa  522  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  42 
 
 
635 aa  525  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  41.15 
 
 
637 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 
635 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  40.03 
 
 
644 aa  518  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  40.98 
 
 
636 aa  514  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  40.82 
 
 
641 aa  511  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  40.44 
 
 
640 aa  509  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  40.77 
 
 
647 aa  507  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  43.61 
 
 
639 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  39.87 
 
 
641 aa  496  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  40.09 
 
 
630 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  39.84 
 
 
630 aa  490  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  40.06 
 
 
629 aa  488  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  39.69 
 
 
639 aa  480  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  38.77 
 
 
634 aa  474  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 
636 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 
635 aa  433  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  36.93 
 
 
640 aa  423  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  36.15 
 
 
634 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  36.26 
 
 
634 aa  410  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  35.18 
 
 
422 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 
422 aa  280  8e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 
426 aa  279  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 
422 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 
421 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 
464 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 
468 aa  212  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  30.2 
 
 
467 aa  211  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 
821 aa  211  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.07 
 
 
543 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.06 
 
 
466 aa  207  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.46 
 
 
466 aa  206  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 
465 aa  203  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 
531 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 
465 aa  201  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
830 aa  201  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  31.21 
 
 
468 aa  199  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.54 
 
 
540 aa  198  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  30.04 
 
 
468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 
468 aa  195  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 
466 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 
515 aa  195  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 
433 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 
464 aa  194  6e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  28.83 
 
 
468 aa  193  8e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.6 
 
 
452 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
467 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 
433 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  29.36 
 
 
455 aa  192  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  29.55 
 
 
467 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.96 
 
 
460 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  29.75 
 
 
467 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  29.11 
 
 
767 aa  191  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 
460 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.35 
 
 
465 aa  190  5.999999999999999e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 
455 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 
455 aa  190  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  29.69 
 
 
455 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 
544 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.11 
 
 
455 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 
472 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  30.61 
 
 
441 aa  189  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.25 
 
 
541 aa  188  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 
453 aa  188  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  28.98 
 
 
469 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 
451 aa  187  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.1 
 
 
530 aa  187  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.39 
 
 
471 aa  187  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  32.94 
 
 
425 aa  187  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  29.62 
 
 
460 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  30.56 
 
 
465 aa  187  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 
452 aa  187  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  31.31 
 
 
485 aa  186  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 
433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0797  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.02 
 
 
477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  30.04 
 
 
470 aa  186  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 
477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  29.4 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 
525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 
433 aa  185  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  26.65 
 
 
570 aa  185  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15900  metallo-beta-lactamase family protein  30.87 
 
 
510 aa  184  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  27.02 
 
 
452 aa  183  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 
425 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
454 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2114  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  29.76 
 
 
486 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
454 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 
470 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 
428 aa  182  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 
547 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>