More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1199 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  53.17 
 
 
647 aa  706    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  82.38 
 
 
630 aa  1107    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  78.59 
 
 
639 aa  1067    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  69.18 
 
 
636 aa  936    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  61.85 
 
 
637 aa  838    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
630 aa  1295    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  56.7 
 
 
644 aa  778    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  57.48 
 
 
644 aa  784    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  54.66 
 
 
634 aa  707    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  76.83 
 
 
629 aa  1019    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  60.69 
 
 
636 aa  820    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  52.98 
 
 
635 aa  686    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  54.32 
 
 
640 aa  726    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  52.82 
 
 
635 aa  686    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  55.09 
 
 
641 aa  752    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  51.1 
 
 
635 aa  681    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  52.51 
 
 
635 aa  686    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  56.9 
 
 
641 aa  776    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  65.2 
 
 
635 aa  888    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  52.98 
 
 
635 aa  687    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  45.95 
 
 
642 aa  572  1.0000000000000001e-162  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  44.35 
 
 
635 aa  552  1e-156  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  40.59 
 
 
636 aa  511  1e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  41.5 
 
 
639 aa  503  1e-141  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  40.09 
 
 
646 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  42.35 
 
 
640 aa  476  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  41.71 
 
 
634 aa  466  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  41.8 
 
 
634 aa  463  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  40.59 
 
 
635 aa  462  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  35.47 
 
 
426 aa  281  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 
422 aa  257  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 
422 aa  257  6e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
422 aa  253  6e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
421 aa  243  7e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.4 
 
 
540 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.78 
 
 
543 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
468 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 
465 aa  216  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 
547 aa  212  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  32.83 
 
 
465 aa  211  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.83 
 
 
541 aa  209  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 
460 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 
821 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.56 
 
 
536 aa  208  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.26 
 
 
465 aa  208  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  31.75 
 
 
468 aa  207  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  30.63 
 
 
468 aa  206  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.41 
 
 
460 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  29.56 
 
 
467 aa  206  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 
524 aa  203  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.18 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  31.28 
 
 
535 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 
468 aa  202  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.18 
 
 
474 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 
465 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 
460 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 
463 aa  201  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  29.65 
 
 
468 aa  200  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  30.32 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 
522 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  33.19 
 
 
411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 
432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 
525 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.89 
 
 
467 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  30.3 
 
 
469 aa  197  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
515 aa  197  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.59 
 
 
471 aa  196  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 
422 aa  196  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  31.02 
 
 
467 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 
461 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
464 aa  195  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 
421 aa  195  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.67 
 
 
470 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.36 
 
 
452 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 
536 aa  194  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  30.37 
 
 
467 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 
464 aa  193  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 
535 aa  193  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 
467 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 
452 aa  193  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 
531 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 
467 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  30.44 
 
 
465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
451 aa  190  5e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
464 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.93 
 
 
466 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 
544 aa  189  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  33.03 
 
 
397 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 
422 aa  189  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
454 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 
570 aa  188  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
454 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  32.33 
 
 
425 aa  187  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2716  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 
481 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.521064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  32.01 
 
 
452 aa  187  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 
466 aa  187  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.12 
 
 
466 aa  186  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 
411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2642  hypothetical protein  30.73 
 
 
455 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  30.02 
 
 
455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>