More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0190 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  53.2 
 
 		 636 aa  695    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  98.9 
 
 		 635 aa  1290    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  99.84 
 
 		 635 aa  1301    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  51 
 
 		 647 aa  664    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 635 aa  1302    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  51.72 
 
 		 637 aa  710    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  48.14 
 
 		 644 aa  658    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  52.51 
 
 		 630 aa  686    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  84.09 
 
 		 635 aa  1147    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  52.66 
 
 		 629 aa  671    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  52.66 
 
 		 636 aa  713    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  94.33 
 
 		 635 aa  1244    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  52.98 
 
 		 630 aa  687    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  51.16 
 
 		 639 aa  681    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  47.81 
 
 		 641 aa  637    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  55.49 
 
 		 635 aa  742    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  48.29 
 
 		 644 aa  657    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  47.96 
 
 		 641 aa  649    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  47.81 
 
 		 640 aa  621  1e-176  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  47 
 
 		 634 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  46.47 
 
 		 642 aa  575  1.0000000000000001e-162  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  46.37 
 
 		 635 aa  552  1e-156  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  42 
 
 		 646 aa  525  1e-147  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  41.56 
 
 		 639 aa  503  1e-141  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  39.75 
 
 		 636 aa  462  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  38.85 
 
 		 640 aa  435  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 		 635 aa  428  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  37.6 
 
 		 634 aa  425  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  37.58 
 
 		 634 aa  419  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  35.65 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 		 422 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 		 422 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  34.61 
 
 		 422 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 421 aa  251  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  33.25 
 
 		 468 aa  227  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 		 821 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.3 
 
 		 543 aa  220  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.06 
 
 		 541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 463 aa  212  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 		 432 aa  212  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 422 aa  211  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 		 531 aa  206  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 465 aa  206  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.95 
 
 		 460 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 		 452 aa  204  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.32 
 
 		 410 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.69 
 
 		 540 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  32.56 
 
 		 767 aa  201  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  30.44 
 
 		 460 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 		 433 aa  200  6e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 		 421 aa  200  7e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 425 aa  200  7.999999999999999e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  31.14 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 536 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 515 aa  197  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.66 
 
 		 465 aa  197  6e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 428 aa  196  9e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 		 433 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 460 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  30.72 
 
 		 455 aa  195  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 		 547 aa  195  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 425 aa  194  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  30.55 
 
 		 465 aa  194  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  30.84 
 
 		 454 aa  194  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 455 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 454 aa  193  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 		 433 aa  193  9e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 454 aa  193  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  30.51 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 		 433 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 		 536 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  26.95 
 
 		 544 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  29.15 
 
 		 469 aa  191  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  30.56 
 
 		 468 aa  191  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.38 
 
 		 467 aa  191  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  28.94 
 
 		 467 aa  191  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 		 468 aa  191  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  27.58 
 
 		 535 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  31.07 
 
 		 453 aa  190  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 		 466 aa  190  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  29.4 
 
 		 441 aa  190  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  32.53 
 
 		 411 aa  190  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 		 421 aa  190  8e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1775  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 477 aa  190  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.164082  normal  0.0243284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1367  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 		 477 aa  190  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 467 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 524 aa  188  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 536 aa  188  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 		 570 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  29.08 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.36 
 
 		 536 aa  187  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  28.72 
 
 		 469 aa  187  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  29.71 
 
 		 452 aa  187  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  29.62 
 
 		 462 aa  187  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  29.62 
 
 		 462 aa  187  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 476 aa  187  7e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  29.01 
 
 		 476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>