More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0966 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  47.34 
 
 
635 aa  642    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  57.84 
 
 
630 aa  775    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
641 aa  1314    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  48.43 
 
 
635 aa  659    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  84.69 
 
 
641 aa  1130    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  56.74 
 
 
637 aa  768    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  47.81 
 
 
635 aa  646    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  57.21 
 
 
630 aa  779    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  71.88 
 
 
640 aa  976    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  57.46 
 
 
629 aa  777    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  47.81 
 
 
635 aa  645    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  55.8 
 
 
636 aa  766    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  57.14 
 
 
636 aa  780    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  57.96 
 
 
639 aa  788    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  84.76 
 
 
644 aa  1141    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  85.85 
 
 
644 aa  1146    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  48.12 
 
 
635 aa  654    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  56.79 
 
 
635 aa  764    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  52.63 
 
 
647 aa  711    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  71.09 
 
 
634 aa  937    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  45.56 
 
 
642 aa  576  1.0000000000000001e-163  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  43.36 
 
 
635 aa  554  1e-156  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 
646 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 
639 aa  510  1e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  36.87 
 
 
636 aa  465  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  39.25 
 
 
634 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
640 aa  451  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  37.64 
 
 
634 aa  444  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  37.13 
 
 
635 aa  438  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 
426 aa  244  5e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
422 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 
422 aa  234  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 
422 aa  234  5e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.56 
 
 
543 aa  228  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.8 
 
 
536 aa  222  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 
421 aa  221  5e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 
525 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.63 
 
 
541 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 
570 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  30.75 
 
 
469 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 
460 aa  210  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  30.39 
 
 
468 aa  209  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.48 
 
 
540 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  32.83 
 
 
451 aa  209  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 
547 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 
522 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  30.99 
 
 
467 aa  207  5e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  29.98 
 
 
535 aa  206  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  31.97 
 
 
468 aa  206  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.59 
 
 
460 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 
544 aa  206  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  31.59 
 
 
460 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
464 aa  203  8e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  30.44 
 
 
470 aa  203  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 
821 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
465 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5620  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 
473 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2716  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 
481 aa  201  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.521064 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  31.56 
 
 
470 aa  200  7e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  30.91 
 
 
467 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 
461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  29.98 
 
 
531 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 
470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  31.75 
 
 
476 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  30.52 
 
 
524 aa  196  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.67 
 
 
525 aa  196  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  31.04 
 
 
467 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 
453 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 
461 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  30.91 
 
 
469 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
515 aa  195  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 
536 aa  194  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  28.6 
 
 
536 aa  193  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.64 
 
 
452 aa  193  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.94 
 
 
464 aa  193  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  29.47 
 
 
455 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
462 aa  193  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 
466 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
460 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.6 
 
 
467 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.57 
 
 
530 aa  192  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 
830 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.73 
 
 
474 aa  191  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 
452 aa  191  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.02 
 
 
465 aa  191  4e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 
467 aa  191  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 
464 aa  191  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  30.44 
 
 
467 aa  190  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
464 aa  189  9e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 
463 aa  190  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 
467 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  30.94 
 
 
465 aa  189  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  29.27 
 
 
468 aa  189  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.09 
 
 
410 aa  187  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  31.26 
 
 
452 aa  188  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
478 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.72 
 
 
480 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.59 
 
 
466 aa  187  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>