More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0455 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
636 aa  1293    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  50.94 
 
 
635 aa  630  1e-179  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
640 aa  627  1e-178  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  48.58 
 
 
634 aa  608  1e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  50.63 
 
 
634 aa  600  1e-170  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  43.1 
 
 
639 aa  523  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  41.73 
 
 
630 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  40.59 
 
 
630 aa  511  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  40.62 
 
 
636 aa  509  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  40.81 
 
 
635 aa  511  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  41.1 
 
 
639 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  44.3 
 
 
642 aa  507  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  40.78 
 
 
637 aa  501  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  43.94 
 
 
635 aa  490  1e-137  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  40.37 
 
 
636 aa  489  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  40.25 
 
 
629 aa  490  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  36.88 
 
 
641 aa  475  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  39.38 
 
 
647 aa  474  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  38.66 
 
 
634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 
646 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  40.22 
 
 
635 aa  462  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  36.56 
 
 
644 aa  465  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  39.75 
 
 
635 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 
635 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  36.87 
 
 
641 aa  464  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  39.6 
 
 
635 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  35.64 
 
 
644 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  38.35 
 
 
635 aa  451  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  35.39 
 
 
640 aa  438  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 
422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 
422 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 
422 aa  250  7e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
426 aa  248  3e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
421 aa  239  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.42 
 
 
541 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  29.82 
 
 
767 aa  207  6e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.1 
 
 
543 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.63 
 
 
466 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  30.74 
 
 
793 aa  202  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 
433 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.22 
 
 
455 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 
425 aa  198  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 
421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.88 
 
 
460 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  30.61 
 
 
468 aa  195  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  29.49 
 
 
467 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 
544 aa  194  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 
447 aa  194  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.21 
 
 
540 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
421 aa  192  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.89 
 
 
466 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 
460 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  28.85 
 
 
467 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  27.67 
 
 
535 aa  190  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 
821 aa  189  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 
460 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 
536 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  29.72 
 
 
884 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 
830 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
425 aa  188  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  29.68 
 
 
468 aa  187  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.38 
 
 
536 aa  188  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 
531 aa  187  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 
465 aa  187  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  27.82 
 
 
469 aa  187  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.35 
 
 
450 aa  187  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 
536 aa  186  8e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  31.12 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  27.39 
 
 
467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 
515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 
432 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 
430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  30.25 
 
 
460 aa  185  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  30.92 
 
 
478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.42 
 
 
474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.77 
 
 
465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 
547 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 
524 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 
536 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 
433 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 
467 aa  184  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  28.73 
 
 
468 aa  183  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  29.14 
 
 
470 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.14 
 
 
452 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.24 
 
 
467 aa  183  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  30.98 
 
 
422 aa  182  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.6 
 
 
470 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 
422 aa  182  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 
525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 
451 aa  181  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
433 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 
433 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.74 
 
 
471 aa  180  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 
472 aa  180  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 
464 aa  180  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  30.84 
 
 
480 aa  180  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.84 
 
 
480 aa  180  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 
428 aa  180  8e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 
468 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  30.46 
 
 
602 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>