More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0309 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
639 aa  1284    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  48.48 
 
 
635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  46.61 
 
 
642 aa  564  1.0000000000000001e-159  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  42.86 
 
 
647 aa  530  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  43.12 
 
 
640 aa  529  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  43.35 
 
 
635 aa  526  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  43.1 
 
 
636 aa  523  1e-147  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  43.17 
 
 
636 aa  523  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  42.12 
 
 
630 aa  523  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  41.34 
 
 
641 aa  520  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  42.23 
 
 
637 aa  515  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  42 
 
 
629 aa  508  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  40.16 
 
 
641 aa  509  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  43.61 
 
 
646 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  40.53 
 
 
644 aa  508  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  41.88 
 
 
635 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  41.5 
 
 
630 aa  503  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  41.77 
 
 
635 aa  502  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  41.56 
 
 
635 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  41.32 
 
 
639 aa  504  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  42.39 
 
 
634 aa  500  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  40.19 
 
 
644 aa  499  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  42.14 
 
 
635 aa  498  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  40.94 
 
 
635 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  39.41 
 
 
636 aa  492  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  42.01 
 
 
635 aa  489  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 
640 aa  484  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  41.01 
 
 
634 aa  474  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  41.61 
 
 
634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
426 aa  251  3e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  34.77 
 
 
422 aa  243  7e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  34.77 
 
 
422 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 
422 aa  240  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  34.71 
 
 
821 aa  230  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  34.05 
 
 
421 aa  229  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.33 
 
 
465 aa  208  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  31.51 
 
 
767 aa  209  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.42 
 
 
543 aa  207  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 
433 aa  207  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  33.7 
 
 
411 aa  206  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  34 
 
 
485 aa  205  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 
468 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 
531 aa  203  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 
433 aa  203  6e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  32.75 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.69 
 
 
541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
425 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  29.05 
 
 
467 aa  198  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 
464 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  29.65 
 
 
468 aa  197  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 
830 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 
468 aa  195  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  31.09 
 
 
465 aa  195  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 
464 aa  194  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 
460 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 
433 aa  194  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 
468 aa  194  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
433 aa  194  6e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 
460 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  32.17 
 
 
454 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  32.76 
 
 
432 aa  193  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
454 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
454 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.69 
 
 
460 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 
570 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  33.55 
 
 
452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  30.11 
 
 
462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  30.85 
 
 
455 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 
461 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 
451 aa  191  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 
455 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
465 aa  190  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.34 
 
 
474 aa  190  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  30.31 
 
 
452 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  29.88 
 
 
793 aa  188  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 
457 aa  188  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  28.54 
 
 
544 aa  188  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.13 
 
 
540 aa  187  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
452 aa  187  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  29.98 
 
 
455 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 
547 aa  187  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 
525 aa  187  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.45 
 
 
455 aa  187  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.63 
 
 
536 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  30.74 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  30.65 
 
 
465 aa  184  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.61 
 
 
467 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  29.44 
 
 
452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  30.38 
 
 
453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  27.87 
 
 
536 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
467 aa  184  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  30.91 
 
 
884 aa  183  8.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 
465 aa  183  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1775  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
477 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.164082  normal  0.0243284 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 
524 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  29.48 
 
 
469 aa  183  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.76 
 
 
450 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  29.4 
 
 
467 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>