More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0777 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  52.51 
 
 
635 aa  686    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  52.51 
 
 
635 aa  686    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  52.93 
 
 
647 aa  696    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  70.6 
 
 
636 aa  959    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  54.57 
 
 
634 aa  702    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  62.01 
 
 
637 aa  842    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  82.38 
 
 
630 aa  1107    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  85.31 
 
 
639 aa  1144    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  57.68 
 
 
641 aa  771    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  57.08 
 
 
644 aa  777    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  52.51 
 
 
635 aa  686    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  80.79 
 
 
629 aa  1064    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
630 aa  1297    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  60.85 
 
 
636 aa  832    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  56.34 
 
 
641 aa  758    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  52.19 
 
 
635 aa  684    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  57.85 
 
 
644 aa  780    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  49.84 
 
 
635 aa  668    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  64.09 
 
 
635 aa  886    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  55.02 
 
 
640 aa  733    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  46.92 
 
 
642 aa  566  1e-160  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  45.48 
 
 
635 aa  553  1e-156  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  42.12 
 
 
639 aa  523  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  41.73 
 
 
636 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  39.84 
 
 
646 aa  490  1e-137  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  42.95 
 
 
640 aa  478  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 
635 aa  474  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  42.72 
 
 
634 aa  473  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  42.7 
 
 
634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  35.08 
 
 
426 aa  273  9e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
422 aa  267  4e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
422 aa  267  5e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
422 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  35.08 
 
 
421 aa  256  6e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.19 
 
 
536 aa  227  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 
468 aa  222  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.46 
 
 
543 aa  221  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.98 
 
 
540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 
465 aa  214  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  30.06 
 
 
467 aa  213  7e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
468 aa  212  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 
547 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  32.62 
 
 
465 aa  209  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  30.19 
 
 
468 aa  208  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  31.15 
 
 
469 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  31.68 
 
 
468 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 
465 aa  207  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.68 
 
 
465 aa  206  7e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  32.06 
 
 
467 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  31.22 
 
 
467 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  30.57 
 
 
535 aa  204  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 
451 aa  204  5e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
536 aa  203  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.82 
 
 
541 aa  203  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.34 
 
 
460 aa  203  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  32.58 
 
 
468 aa  203  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.47 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 
821 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 
525 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 
544 aa  200  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 
460 aa  200  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 
535 aa  200  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 
524 aa  200  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  31.93 
 
 
432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 
461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
463 aa  197  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  30.67 
 
 
470 aa  197  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  31.32 
 
 
531 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 
422 aa  196  9e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
421 aa  196  9e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.53 
 
 
455 aa  196  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 
467 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  30.74 
 
 
470 aa  195  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 
464 aa  194  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 
461 aa  195  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 
467 aa  194  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 
570 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.64 
 
 
452 aa  194  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  32.43 
 
 
452 aa  194  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 
522 aa  193  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 
464 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  34.04 
 
 
425 aa  192  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 
460 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  31.76 
 
 
411 aa  191  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 
830 aa  191  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 
467 aa  190  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 
462 aa  190  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.84 
 
 
464 aa  190  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  29.64 
 
 
452 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
466 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
422 aa  189  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.09 
 
 
466 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 
455 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  30.7 
 
 
478 aa  188  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 
464 aa  188  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.82 
 
 
530 aa  188  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
465 aa  188  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  28.96 
 
 
536 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.43 
 
 
466 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>