More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0375 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  52.51 
 
 
635 aa  711    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  54.25 
 
 
647 aa  739    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  60.69 
 
 
630 aa  820    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  53.29 
 
 
635 aa  724    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  56.01 
 
 
636 aa  766    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  77.71 
 
 
637 aa  1073    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  52.66 
 
 
635 aa  713    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  53.83 
 
 
640 aa  719    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  58.33 
 
 
629 aa  782    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  53.14 
 
 
634 aa  698    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
636 aa  1314    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  55.92 
 
 
644 aa  763    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  52.66 
 
 
635 aa  712    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  56.34 
 
 
641 aa  766    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  60.85 
 
 
630 aa  832    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  55.64 
 
 
641 aa  762    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  66.19 
 
 
635 aa  934    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  52.19 
 
 
635 aa  708    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  58.09 
 
 
639 aa  800    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  57.63 
 
 
644 aa  782    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 
642 aa  593  1e-168  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  48.41 
 
 
635 aa  580  1e-164  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  43.68 
 
 
646 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  43.17 
 
 
639 aa  523  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  40.62 
 
 
636 aa  509  1e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  40.68 
 
 
640 aa  457  1e-127  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  40.86 
 
 
634 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 
635 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  40.16 
 
 
634 aa  450  1e-125  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  36.4 
 
 
426 aa  267  4e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  33.56 
 
 
422 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  33.56 
 
 
422 aa  252  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
422 aa  249  9e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  32.96 
 
 
421 aa  241  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.89 
 
 
540 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.22 
 
 
543 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 
460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 
460 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.67 
 
 
460 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 
463 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 
468 aa  210  7e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  31.87 
 
 
470 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  32.96 
 
 
452 aa  206  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 
465 aa  206  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  29.85 
 
 
535 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  32.3 
 
 
464 aa  205  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 
524 aa  204  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.65 
 
 
536 aa  204  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  31.58 
 
 
469 aa  203  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 
461 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.39 
 
 
541 aa  203  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  30.94 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 
433 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 
821 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 
830 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 
464 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 
468 aa  201  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 
453 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 
531 aa  201  5e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.41 
 
 
465 aa  201  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
547 aa  200  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  35.03 
 
 
433 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
455 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  35.73 
 
 
433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  30.64 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
536 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  32.04 
 
 
468 aa  199  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  30.8 
 
 
453 aa  198  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 
515 aa  198  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.02 
 
 
525 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 
454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 
454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  31.29 
 
 
477 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 
421 aa  197  6e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 
522 aa  197  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.93 
 
 
452 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 
464 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
472 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 
536 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 
452 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  28.3 
 
 
467 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  28.54 
 
 
468 aa  194  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 
451 aa  194  4e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.59 
 
 
470 aa  194  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 
536 aa  194  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 
467 aa  194  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 
465 aa  193  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
432 aa  193  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 
465 aa  192  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.89 
 
 
467 aa  193  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 
462 aa  191  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.95 
 
 
469 aa  191  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  29.48 
 
 
476 aa  191  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 
452 aa  191  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 
544 aa  190  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.38 
 
 
530 aa  189  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  29.32 
 
 
452 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.94 
 
 
466 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  29.56 
 
 
441 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>