More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0446 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
428 aa  863    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  46.81 
 
 
425 aa  373  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  45.86 
 
 
425 aa  364  2e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  45.28 
 
 
428 aa  359  5e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  45.15 
 
 
430 aa  353  2e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  41.61 
 
 
422 aa  341  2e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  41.39 
 
 
422 aa  333  4e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 
421 aa  324  2e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 
421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.97 
 
 
410 aa  257  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 
433 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 
433 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  37.14 
 
 
411 aa  242  7e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 
433 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.92 
 
 
432 aa  238  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  35.06 
 
 
411 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  33.26 
 
 
429 aa  236  6e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  35.95 
 
 
411 aa  232  9e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 
414 aa  229  6e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  35.57 
 
 
397 aa  229  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 
432 aa  226  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 
433 aa  226  6e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  34.73 
 
 
640 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 
634 aa  196  6e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
635 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
635 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  31.7 
 
 
821 aa  196  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 
635 aa  193  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 
635 aa  193  6e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 
635 aa  192  8e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 
634 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  34.63 
 
 
637 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 
635 aa  190  5e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 
639 aa  186  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  31.57 
 
 
635 aa  183  6e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 
636 aa  180  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  32.27 
 
 
426 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.46 
 
 
636 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  30.64 
 
 
647 aa  177  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 
642 aa  177  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
630 aa  176  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 
422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  30.79 
 
 
422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  30.79 
 
 
422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 
639 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 
640 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  33.1 
 
 
636 aa  170  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  31.57 
 
 
630 aa  169  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  30.3 
 
 
629 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  30.37 
 
 
644 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  32.56 
 
 
635 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 
457 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 
646 aa  160  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
476 aa  159  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  29.86 
 
 
813 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.15 
 
 
644 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 
830 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.48 
 
 
455 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
641 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 
531 aa  154  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 
634 aa  153  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 
421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 
641 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
472 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
465 aa  150  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  30.02 
 
 
667 aa  150  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
454 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  27.99 
 
 
468 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 
515 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  31.14 
 
 
767 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.39 
 
 
540 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
456 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  30.79 
 
 
452 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 
462 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.26 
 
 
466 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 
464 aa  143  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  30.2 
 
 
469 aa  142  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  28.77 
 
 
602 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  27.72 
 
 
467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.79 
 
 
490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 
451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  30.45 
 
 
470 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.69 
 
 
454 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.45 
 
 
481 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.14 
 
 
541 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  28.8 
 
 
467 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  28.76 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  28.15 
 
 
465 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  28.2 
 
 
453 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.61 
 
 
467 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3425  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.1 
 
 
451 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.68 
 
 
543 aa  136  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 
478 aa  136  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  29.12 
 
 
476 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  27.09 
 
 
884 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 
467 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>