More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1548 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  81.41 
 
 
425 aa  731    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  77 
 
 
428 aa  680    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
425 aa  860    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  83.18 
 
 
430 aa  721    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  54.9 
 
 
422 aa  476  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  45.86 
 
 
428 aa  364  2e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  41.61 
 
 
422 aa  318  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  42.53 
 
 
421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  36.93 
 
 
421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.14 
 
 
410 aa  270  4e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  37.68 
 
 
411 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  37.11 
 
 
411 aa  243  7e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 
433 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 
414 aa  235  9e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  34.75 
 
 
411 aa  234  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 
429 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 
433 aa  229  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.47 
 
 
432 aa  227  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 
433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
432 aa  226  6e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 
433 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  36.36 
 
 
397 aa  219  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  35.6 
 
 
642 aa  204  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 
635 aa  204  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 
635 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  34.03 
 
 
635 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
635 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
635 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  34.22 
 
 
635 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
635 aa  196  9e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 
422 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  34.17 
 
 
634 aa  189  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 
635 aa  188  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
636 aa  188  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 
630 aa  187  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
640 aa  186  5e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 
639 aa  186  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
634 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  31.82 
 
 
637 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 
422 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  32.78 
 
 
630 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 
426 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 
646 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
639 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  32.12 
 
 
636 aa  179  9e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.79 
 
 
636 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  31.43 
 
 
629 aa  177  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 
640 aa  176  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.11 
 
 
647 aa  175  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 
821 aa  171  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 
421 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  29.6 
 
 
644 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.98 
 
 
467 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  30.75 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  28.86 
 
 
644 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 
641 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.43 
 
 
466 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 
454 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 
454 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 
634 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 
641 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  29.35 
 
 
452 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 
455 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 
465 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.15 
 
 
455 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.9 
 
 
541 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 
476 aa  154  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  29.84 
 
 
468 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  29.4 
 
 
470 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 
467 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 
465 aa  150  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  28.48 
 
 
469 aa  149  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 
830 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  28.35 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.24 
 
 
540 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 
460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  28.13 
 
 
452 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 
468 aa  147  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 
454 aa  146  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 
667 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.13 
 
 
460 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  28.6 
 
 
468 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1402  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
525 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  29.09 
 
 
467 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  29.06 
 
 
467 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 
456 aa  143  7e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 
652 aa  142  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.92 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  28.21 
 
 
767 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  27.31 
 
 
468 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 
452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  27.33 
 
 
455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.23 
 
 
471 aa  140  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  28.51 
 
 
452 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>