More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_28482 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  100 
 
 		 602 aa  1249    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  48.51 
 
 		 767 aa  545  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02710  hypothetical protein  41.74 
 
 		 773 aa  482  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  39.29 
 
 		 793 aa  471  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  38.91 
 
 		 884 aa  459  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 640 aa  205  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 		 635 aa  204  6e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 634 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 		 635 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 821 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  29.68 
 
 		 635 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 635 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 635 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  29.68 
 
 		 635 aa  192  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  30.46 
 
 		 636 aa  192  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 		 447 aa  186  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.03 
 
 		 635 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 		 646 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 642 aa  184  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 630 aa  183  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 422 aa  183  7e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 422 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  29.4 
 
 		 635 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 		 456 aa  180  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  29.31 
 
 		 647 aa  179  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  30.02 
 
 		 830 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 		 639 aa  178  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.77 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 433 aa  177  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 468 aa  174  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 421 aa  173  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  29.04 
 
 		 634 aa  171  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  28.66 
 
 		 629 aa  171  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  28.22 
 
 		 636 aa  171  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 433 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  28.6 
 
 		 455 aa  170  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  28.94 
 
 		 639 aa  169  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 		 472 aa  169  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  28.01 
 
 		 640 aa  167  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  26.49 
 
 		 433 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 		 451 aa  167  8e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 630 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  28.01 
 
 		 472 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  28.01 
 
 		 472 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  28.01 
 
 		 472 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  27.71 
 
 		 589 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  27.8 
 
 		 472 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  28.07 
 
 		 459 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  28.64 
 
 		 452 aa  163  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.55 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  28.16 
 
 		 637 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  27.8 
 
 		 603 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  29.5 
 
 		 441 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  28.38 
 
 		 644 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.75 
 
 		 540 aa  159  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 515 aa  158  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 		 425 aa  158  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  26.91 
 
 		 469 aa  158  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  28.25 
 
 		 454 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 		 457 aa  158  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  28.77 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  28.79 
 
 		 470 aa  156  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.56 
 
 		 636 aa  157  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.26 
 
 		 465 aa  156  9e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.9 
 
 		 543 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  27.17 
 
 		 644 aa  154  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  29.79 
 
 		 452 aa  154  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.93 
 
 		 541 aa  154  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 		 461 aa  153  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  29.73 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 464 aa  152  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 		 477 aa  151  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  28.79 
 
 		 452 aa  150  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 		 454 aa  150  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.57 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 		 465 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0797  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.39 
 
 		 477 aa  148  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  28.84 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  28.14 
 
 		 453 aa  148  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3425  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.51 
 
 		 451 aa  148  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 		 454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 464 aa  147  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5620  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.25 
 
 		 530 aa  147  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>