More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1566 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1566  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
441 aa  891    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0665026  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 
639 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
635 aa  151  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  31.1 
 
 
767 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  28.22 
 
 
635 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
635 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  28.54 
 
 
642 aa  144  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 
634 aa  143  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 
640 aa  142  9e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  27.69 
 
 
637 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 
422 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  25.29 
 
 
793 aa  139  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  28.32 
 
 
647 aa  139  7.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 
515 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 
426 aa  137  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
635 aa  137  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 
422 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 
422 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1755  metallo-beta-lactamase family protein  25.58 
 
 
419 aa  136  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3588  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
646 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
636 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 
821 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 
640 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 
635 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  26.65 
 
 
636 aa  133  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 
635 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 
635 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
641 aa  132  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  28.42 
 
 
644 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
635 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 
634 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02710  hypothetical protein  27.33 
 
 
773 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  27.84 
 
 
602 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  26.58 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 
634 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  26.92 
 
 
629 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  26.58 
 
 
452 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  28.42 
 
 
644 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 
454 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1737  metallo-beta-lactamase family protein  25.23 
 
 
419 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 
454 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.74 
 
 
636 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 
432 aa  125  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 
630 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 
641 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1613  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
436 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1574  Zn-dependent hydrolase  25.23 
 
 
436 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000156356  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 
639 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1868  metallo-beta-lactamase family protein  24.77 
 
 
419 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1613  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 
420 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 
470 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1814  metallo-beta-lactamase family protein  24.83 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1565  zinc-dependent hydrolase  24.59 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1788  metallo-beta-lactamase family protein  23.83 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  25.61 
 
 
884 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  28.68 
 
 
468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 
467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 
630 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.81 
 
 
450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 
468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 
460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  25.71 
 
 
455 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  26.99 
 
 
455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 
535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.53 
 
 
470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  25.24 
 
 
830 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.91 
 
 
481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  28.53 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  25.9 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2452  beta-lactamase domain-containing protein  28.01 
 
 
547 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654056  normal  0.754885 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.89 
 
 
540 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 
536 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  26.21 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  25 
 
 
470 aa  114  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 
454 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  26.34 
 
 
469 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  29.54 
 
 
433 aa  112  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  28.3 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.72 
 
 
541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 
531 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 
477 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  29.44 
 
 
452 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.43 
 
 
490 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  29.2 
 
 
467 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 
464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  28.68 
 
 
467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 
455 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
411 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  26.48 
 
 
433 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 
461 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 
433 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  23.88 
 
 
469 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>