88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0960 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  100 
 
 		 267 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  48.05 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  49.17 
 
 		 254 aa  239  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  41.41 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  43.53 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  46.15 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  46.03 
 
 		 263 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  45.57 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  42.48 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  41.54 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.43 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  44.21 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  39.84 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  38.13 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  37.35 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  38.52 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 		 252 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  34.04 
 
 		 796 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  27.69 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  28.22 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  27.8 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.36 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.53 
 
 		 345 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.53 
 
 		 345 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.53 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.02 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  28.25 
 
 		 295 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  39.66 
 
 		 561 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.67 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  24 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  26.8 
 
 		 411 aa  48.9  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  24 
 
 		 319 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 		 285 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 		 285 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  26.01 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.92 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  25.32 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.02 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  26.04 
 
 		 314 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  27.45 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3129  adenosylcobinamide kinase  32.14 
 
 		 507 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.79 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 555 aa  45.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  26.01 
 
 		 557 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  25.44 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 		 557 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0893  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0178503  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.23 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 557 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  25.75 
 
 		 393 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  28.43 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.7 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  32.35 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02190  conserved hypothetical protein  36.63 
 
 		 549 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.464356  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  25.44 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  33.96 
 
 		 813 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  23.13 
 
 		 421 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.47 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.51 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2421  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 430 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.29 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  23.42 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.99 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  24.05 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1423  beta-lactamase domain-containing protein  48.84 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.408877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  24.34 
 
 		 453 aa  42.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  23.84 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  27.01 
 
 		 492 aa  42.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  26.99 
 
 		 251 aa  42  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 		 243 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>