187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2421 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2421  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
430 aa  840    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2046  hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily-like  29.44 
 
 
437 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.419381  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1639  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.87 
 
 
433 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000492712  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1034  hypothetical protein  22.73 
 
 
519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000166295  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0808  beta-lactamase domain-containing protein  24.95 
 
 
519 aa  106  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.276491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1136  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.04 
 
 
520 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0260  beta-lactamase domain-containing protein  26.49 
 
 
441 aa  90.5  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2899  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
529 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.920708  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4720  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
416 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.209873 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0266  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  27.65 
 
 
522 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0268  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  27.94 
 
 
522 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3639  beta-lactamase domain-containing protein  22.49 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2888  beta-lactamase domain-containing protein  23.33 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  22.91 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0021  beta-lactamase domain protein  22.22 
 
 
422 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3305  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09390  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  26.11 
 
 
560 aa  67  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.293183  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  22.57 
 
 
556 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  22.57 
 
 
556 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  22.57 
 
 
556 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  22.57 
 
 
556 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  22.57 
 
 
556 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  22.57 
 
 
556 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  22.57 
 
 
556 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  22.57 
 
 
556 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  22.09 
 
 
556 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  22.33 
 
 
556 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0859  beta-lactamase domain-containing protein  22.31 
 
 
414 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0698444  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf128  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.74 
 
 
594 aa  63.2  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  23.84 
 
 
555 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  22.33 
 
 
583 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  25.35 
 
 
564 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  21.34 
 
 
572 aa  60.5  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 
580 aa  60.1  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  22.91 
 
 
561 aa  60.1  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0623  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.84 
 
 
611 aa  58.9  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0867442  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.78 
 
 
561 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  25.18 
 
 
650 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1150  hypothetical protein  24.38 
 
 
675 aa  57.8  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.920604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  25.45 
 
 
558 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 
558 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 
558 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
652 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24.23 
 
 
564 aa  57  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1282  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  22.57 
 
 
636 aa  57  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1480  beta-lactamase domain protein  23.63 
 
 
561 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0694172  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  20.45 
 
 
566 aa  57  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  21.53 
 
 
677 aa  57  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  24.66 
 
 
559 aa  56.6  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  30 
 
 
254 aa  56.6  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  23.28 
 
 
563 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0647  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 
551 aa  56.2  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.730868  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
561 aa  56.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0063  beta-lactamase domain protein  21.86 
 
 
664 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl570  putative metallo-beta lactamase hydrolase  21.43 
 
 
588 aa  55.5  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00258207  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0950  putative metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24.65 
 
 
616 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  22.16 
 
 
590 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  22.43 
 
 
561 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1502  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 
561 aa  55.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000603701  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 
559 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  24.57 
 
 
556 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12765  hypothetical protein  27.08 
 
 
558 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.868415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  23.11 
 
 
556 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 
561 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  23.17 
 
 
547 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  22.38 
 
 
548 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  20.74 
 
 
560 aa  54.3  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  21.56 
 
 
573 aa  54.3  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_2719  predicted protein  24.31 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127667  hitchhiker  0.00814758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  26.3 
 
 
561 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 
561 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  25.93 
 
 
561 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 
552 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 
558 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  24.48 
 
 
645 aa  53.5  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 
559 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3999  beta-lactamase domain-containing protein  24.47 
 
 
558 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.818404  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  23.11 
 
 
561 aa  53.1  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
595 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  23.56 
 
 
565 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0842  metallo-beta-lactamase family protein  20.36 
 
 
568 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  22.17 
 
 
631 aa  52.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  20.87 
 
 
558 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  21.49 
 
 
563 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000013396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  21.96 
 
 
554 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 
553 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  23.05 
 
 
563 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1335  beta-lactamase domain-containing protein  20.07 
 
 
574 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.547881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1361  beta-lactamase domain-containing protein  20.07 
 
 
574 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  20.77 
 
 
555 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  22.75 
 
 
561 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  25.38 
 
 
548 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0667  metallo-beta-lactamase domain protein  21.05 
 
 
596 aa  52  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00731629  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 
558 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1821  beta-lactamase domain-containing protein  21.63 
 
 
576 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120027  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  23.42 
 
 
558 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  25.09 
 
 
560 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  23.84 
 
 
561 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  23.42 
 
 
558 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2016  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  20.27 
 
 
578 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0968063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>