252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4720 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4720  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
416 aa  827    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.209873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3305  beta-lactamase domain protein  45.19 
 
 
423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0859  beta-lactamase domain-containing protein  41.07 
 
 
414 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0698444  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0021  beta-lactamase domain protein  35.81 
 
 
422 aa  257  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0260  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2888  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 
429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3639  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 
428 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2421  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1034  hypothetical protein  23.22 
 
 
519 aa  82.8  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000166295  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1639  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  22.44 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000492712  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 
553 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  27.63 
 
 
461 aa  77  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 
650 aa  76.6  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12765  hypothetical protein  27.66 
 
 
558 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.868415 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2899  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 
529 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.920708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1136  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.89 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  23.7 
 
 
555 aa  73.9  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2046  hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily-like  26.22 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.419381  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0950  beta-lactamase domain protein  22.49 
 
 
619 aa  70.9  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  22.44 
 
 
548 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.91 
 
 
561 aa  70.1  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09390  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  24.64 
 
 
560 aa  70.1  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.293183  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  25.42 
 
 
558 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 
558 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 
558 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0306  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  23 
 
 
635 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  25.8 
 
 
561 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  25.92 
 
 
558 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  21.27 
 
 
560 aa  67.8  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  26.16 
 
 
565 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 
561 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  24.46 
 
 
561 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 
550 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 
558 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  21.43 
 
 
544 aa  65.1  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  23.01 
 
 
555 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  22.98 
 
 
560 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  24.94 
 
 
558 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 
563 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000013396 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 
533 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 
561 aa  63.5  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 
562 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  22.51 
 
 
556 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.81 
 
 
558 aa  63.5  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0864  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 
552 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.412848  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 
561 aa  63.2  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  22.87 
 
 
555 aa  63.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  22.99 
 
 
556 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1480  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 
561 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0694172  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 
562 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 
580 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  25.68 
 
 
558 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.04 
 
 
561 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 
559 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  22.66 
 
 
549 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  24.08 
 
 
556 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1170  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  23.5 
 
 
591 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.811184  hitchhiker  0.000000000000102391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 
563 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_2719  predicted protein  21.52 
 
 
413 aa  60.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127667  hitchhiker  0.00814758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 
593 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 
595 aa  60.1  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  23.17 
 
 
560 aa  60.1  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  24.57 
 
 
558 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  21.04 
 
 
618 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  23.5 
 
 
553 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  22.91 
 
 
555 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 
591 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  23.08 
 
 
652 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 
561 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  25.43 
 
 
553 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 
568 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2106  beta-lactamase domain-containing protein  23.72 
 
 
554 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  23.87 
 
 
447 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  22.19 
 
 
544 aa  57.8  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl570  putative metallo-beta lactamase hydrolase  21.84 
 
 
588 aa  58.2  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00258207  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 
561 aa  57.4  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  27.82 
 
 
561 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  25.36 
 
 
561 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  23.6 
 
 
558 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  22.28 
 
 
556 aa  57.4  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 
567 aa  57  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29160  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  22.92 
 
 
561 aa  57  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.813951  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 
555 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3999  beta-lactamase domain-containing protein  24.17 
 
 
558 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.818404  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  24.82 
 
 
554 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  27.67 
 
 
561 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  25.06 
 
 
558 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  22.51 
 
 
557 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  21.52 
 
 
557 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  21.52 
 
 
557 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
559 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  22.49 
 
 
561 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  22.75 
 
 
542 aa  56.2  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0950  putative metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  26.09 
 
 
616 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  23.5 
 
 
564 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 
556 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 
553 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  21.52 
 
 
557 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0808  beta-lactamase domain-containing protein  24.33 
 
 
519 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.276491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  23.99 
 
 
556 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>