144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3639 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2888  beta-lactamase domain-containing protein  84.07 
 
 		 429 aa  763    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3639  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 428 aa  889    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0021  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0859  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 414 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0698444  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3305  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4720  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.209873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0260  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 441 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0808  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 519 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.276491  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2046  hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily-like  23.09 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.419381  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1034  hypothetical protein  25.97 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000166295  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1136  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.62 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1639  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  22.13 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000492712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2421  beta-lactamase domain protein  22.49 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2899  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 		 529 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.920708  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  23.77 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  20.21 
 
 		 558 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  20.21 
 
 		 558 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  20.72 
 
 		 558 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  22.19 
 
 		 555 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  22.33 
 
 		 553 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2106  beta-lactamase domain-containing protein  22.97 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  20.75 
 
 		 544 aa  59.7  0.00000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  22.44 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  19.94 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  21.7 
 
 		 652 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  23.8 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  22.6 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  20.28 
 
 		 555 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  22.12 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  21.88 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  23.28 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  21.45 
 
 		 555 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  20.96 
 
 		 540 aa  56.2  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_2719  predicted protein  22.25 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127667  hitchhiker  0.00814758 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  22.44 
 
 		 560 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  22.75 
 
 		 558 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  21.53 
 
 		 567 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  20.83 
 
 		 557 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  21.45 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0063  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 		 664 aa  54.7  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  20.83 
 
 		 560 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  21.67 
 
 		 556 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 		 652 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  24.3 
 
 		 566 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  21.68 
 
 		 590 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  21.46 
 
 		 662 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  21.11 
 
 		 557 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  21.82 
 
 		 556 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0864  beta-lactamase domain protein  23.96 
 
 		 552 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.412848  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  19.49 
 
 		 557 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  21.45 
 
 		 631 aa  53.5  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  21.5 
 
 		 560 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2016  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.68 
 
 		 578 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0968063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  20.48 
 
 		 662 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  20.99 
 
 		 662 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  20.11 
 
 		 556 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0096  beta-lactamase domain-containing protein  23.95 
 
 		 550 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.458831 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  20.56 
 
 		 557 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  22.76 
 
 		 558 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  19.44 
 
 		 544 aa  51.6  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1821  beta-lactamase domain-containing protein  23.19 
 
 		 576 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120027  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 		 561 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 425 aa  51.2  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  20 
 
 		 557 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  22.63 
 
 		 558 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2089  hypothetical protein  22.81 
 
 		 647 aa  50.4  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  22.27 
 
 		 542 aa  50.8  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 		 425 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  19.78 
 
 		 557 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  21.07 
 
 		 544 aa  50.4  0.00006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  22.16 
 
 		 556 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  19.78 
 
 		 557 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  19.43 
 
 		 557 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  22.48 
 
 		 553 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  21.68 
 
 		 644 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  25.71 
 
 		 533 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  21.91 
 
 		 555 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  25.22 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  24.66 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  22.16 
 
 		 558 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  22.94 
 
 		 546 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15520  beta-lactamase domain protein  22.43 
 
 		 556 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  21.41 
 
 		 556 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2687  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 591 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  21.45 
 
 		 560 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  19.41 
 
 		 555 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  22.13 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  21.59 
 
 		 558 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  19.37 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  19.91 
 
 		 557 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  19.41 
 
 		 555 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  19.19 
 
 		 549 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  20.27 
 
 		 556 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  21.36 
 
 		 555 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  22.93 
 
 		 548 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  27.52 
 
 		 327 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  21.07 
 
 		 548 aa  47  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>