103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1034 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1034  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  1073    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000166295  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1136  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.72 
 
 
520 aa  279  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0808  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 
519 aa  273  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.276491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0268  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  31.25 
 
 
522 aa  226  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0266  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  31.07 
 
 
522 aa  225  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2899  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 
529 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.920708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2421  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 
430 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2888  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 
429 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3639  beta-lactamase domain-containing protein  25.97 
 
 
428 aa  90.5  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2046  hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily-like  26.86 
 
 
437 aa  90.5  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.419381  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4720  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 
416 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.209873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0260  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3305  beta-lactamase domain protein  20.81 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1639  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  21.9 
 
 
433 aa  79.7  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000492712  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 
556 aa  77.4  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0021  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0859  beta-lactamase domain-containing protein  24.18 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0698444  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  26.3 
 
 
550 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  23.99 
 
 
558 aa  64.7  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  23.13 
 
 
555 aa  62  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  21.77 
 
 
551 aa  58.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 
558 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2069  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
449 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1480  beta-lactamase domain protein  23.27 
 
 
561 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0694172  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  21.63 
 
 
561 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1185  beta-lactamase domain-containing protein  24.17 
 
 
448 aa  51.6  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2607  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
448 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.458343 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  22.49 
 
 
555 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0442  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
450 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0970385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  20.88 
 
 
583 aa  51.2  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1821  beta-lactamase domain-containing protein  24.08 
 
 
576 aa  50.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120027  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  21.97 
 
 
557 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  20.7 
 
 
553 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2106  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 
554 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2048  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 
447 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000971225  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2539  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 
450 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24 
 
 
557 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0864  beta-lactamase domain protein  21.35 
 
 
552 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.412848  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  23.57 
 
 
469 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  22.41 
 
 
555 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  21.85 
 
 
554 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 
561 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  20.31 
 
 
558 aa  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  20.72 
 
 
645 aa  48.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  20.31 
 
 
558 aa  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15520  beta-lactamase domain protein  23.43 
 
 
556 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2047  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
450 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0634019  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1041  beta-lactamase domain-containing protein  21.69 
 
 
448 aa  47  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.467823 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  23.91 
 
 
556 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  23.91 
 
 
556 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  23.91 
 
 
556 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  23.91 
 
 
556 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  22.62 
 
 
557 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  23.91 
 
 
556 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  22.54 
 
 
561 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2398  beta-lactamase-like protein  22.73 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000003377  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  22.81 
 
 
452 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  22.5 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  22.62 
 
 
557 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  20.54 
 
 
558 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2210  beta-lactamase domain-containing protein  20.36 
 
 
445 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0905  beta-lactamase domain-containing protein  22.62 
 
 
448 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  24.08 
 
 
593 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  23.91 
 
 
556 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  23.91 
 
 
556 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  23.91 
 
 
556 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  21.23 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  23.03 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  24.74 
 
 
558 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1335  beta-lactamase domain-containing protein  23.45 
 
 
574 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.547881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1361  beta-lactamase domain-containing protein  23.45 
 
 
574 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1059  beta-lactamase domain-containing protein  22.85 
 
 
448 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  43.28 
 
 
561 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  23.55 
 
 
556 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 
455 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  19.01 
 
 
566 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 
568 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  22.92 
 
 
564 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1846  hypothetical protein  20.74 
 
 
609 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.390702 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  21.2 
 
 
428 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 
563 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000013396 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0306  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  23.74 
 
 
635 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  21.43 
 
 
544 aa  44.7  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  22.82 
 
 
561 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  24.33 
 
 
644 aa  45.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  50.88 
 
 
566 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1186  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.91 
 
 
553 aa  44.3  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0623  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.64 
 
 
611 aa  44.3  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0867442  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  21.14 
 
 
561 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  22.44 
 
 
440 aa  44.3  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  23.19 
 
 
556 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0647  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 
551 aa  44.3  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.730868  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  56.1 
 
 
595 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2887  beta-lactamase-like  25.42 
 
 
445 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339587  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  53.66 
 
 
561 aa  44.3  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  56.1 
 
 
561 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  58.97 
 
 
563 aa  43.5  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  22.99 
 
 
562 aa  43.5  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  47.73 
 
 
650 aa  43.5  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>