More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1939 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0864  beta-lactamase domain protein  59.38 
 
 		 552 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.412848  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 555 aa  1124    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  61.54 
 
 		 554 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  63.55 
 
 		 550 aa  737    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  59.96 
 
 		 553 aa  695    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2106  beta-lactamase domain-containing protein  60.25 
 
 		 554 aa  685    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  47.21 
 
 		 558 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  48.1 
 
 		 558 aa  543  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  49.45 
 
 		 561 aa  531  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  46.82 
 
 		 569 aa  528  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  47.33 
 
 		 558 aa  522  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  47.34 
 
 		 558 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  43.78 
 
 		 593 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  45.76 
 
 		 533 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  44.2 
 
 		 555 aa  490  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  43.98 
 
 		 549 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  44.1 
 
 		 554 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  43.12 
 
 		 560 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  43.09 
 
 		 554 aa  485  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  43.69 
 
 		 564 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  43.01 
 
 		 554 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  43.74 
 
 		 559 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.9 
 
 		 555 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  40.62 
 
 		 553 aa  474  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  42.25 
 
 		 558 aa  475  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  42.57 
 
 		 555 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  40.18 
 
 		 555 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  42.75 
 
 		 555 aa  465  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  40.29 
 
 		 554 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  40.75 
 
 		 618 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  41.47 
 
 		 553 aa  457  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  41.12 
 
 		 551 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  40.76 
 
 		 551 aa  450  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  40.94 
 
 		 551 aa  451  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  39.64 
 
 		 555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  39.64 
 
 		 555 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.64 
 
 		 555 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.64 
 
 		 555 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.64 
 
 		 555 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  39.82 
 
 		 555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  39.64 
 
 		 555 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.64 
 
 		 555 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.46 
 
 		 555 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.64 
 
 		 555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  44.4 
 
 		 568 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  41.03 
 
 		 566 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  39.46 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  40.77 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  41.42 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  38.75 
 
 		 560 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  43.83 
 
 		 562 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  43.65 
 
 		 562 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  38.98 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  38.02 
 
 		 677 aa  427  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 560 aa  423  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 		 565 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 		 565 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  40.59 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  43.59 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.17 
 
 		 555 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  41.62 
 
 		 561 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  37.45 
 
 		 662 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  38.91 
 
 		 631 aa  419  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  38.81 
 
 		 561 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  38.7 
 
 		 548 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  40.77 
 
 		 561 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  37.09 
 
 		 662 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  37.09 
 
 		 662 aa  415  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  38.41 
 
 		 561 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  36 
 
 		 652 aa  413  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  37.87 
 
 		 559 aa  414  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  37.21 
 
 		 557 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  36.69 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  37.32 
 
 		 557 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  36.69 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  37.32 
 
 		 557 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  36.69 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  36.69 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  36.69 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.32 
 
 		 557 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  36.69 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  36.33 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  41.56 
 
 		 550 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  35.97 
 
 		 583 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  38.32 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  36.33 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  36.69 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.32 
 
 		 557 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 		 572 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  36.96 
 
 		 557 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  39.82 
 
 		 561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  38.7 
 
 		 560 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  40.9 
 
 		 564 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  40.47 
 
 		 559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  36.01 
 
 		 573 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>