More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0864 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0864  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
552 aa  1113    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.412848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  62.29 
 
 
554 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  67.15 
 
 
553 aa  754    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  59.38 
 
 
555 aa  672    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2106  beta-lactamase domain-containing protein  67.21 
 
 
554 aa  751    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  56.73 
 
 
550 aa  638    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  44.18 
 
 
558 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  43.82 
 
 
549 aa  491  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  44.55 
 
 
593 aa  485  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  46.46 
 
 
561 aa  488  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  43.82 
 
 
558 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  43.27 
 
 
558 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  43.82 
 
 
558 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  43.82 
 
 
569 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  45.16 
 
 
564 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  40.73 
 
 
560 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  41.88 
 
 
554 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  42.48 
 
 
533 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  41.34 
 
 
555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  41.7 
 
 
559 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  41.34 
 
 
554 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.12 
 
 
555 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  40.47 
 
 
558 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  41.12 
 
 
554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  40.76 
 
 
555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  41.44 
 
 
555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  40.97 
 
 
555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  39.89 
 
 
554 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  41.12 
 
 
553 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  39.53 
 
 
553 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 
560 aa  435  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  39.45 
 
 
555 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  39.78 
 
 
551 aa  434  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 
551 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  38.62 
 
 
560 aa  430  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  39.6 
 
 
551 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  38.81 
 
 
618 aa  432  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  38.98 
 
 
565 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  38.98 
 
 
565 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  42.96 
 
 
568 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  39.28 
 
 
555 aa  428  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.74 
 
 
555 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  42.57 
 
 
562 aa  425  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  39.1 
 
 
555 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  38.92 
 
 
555 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  39.1 
 
 
555 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.1 
 
 
555 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.1 
 
 
555 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  39.1 
 
 
555 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  39.86 
 
 
591 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.1 
 
 
555 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.1 
 
 
555 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.92 
 
 
555 aa  423  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  42.75 
 
 
562 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  40.26 
 
 
551 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  40.07 
 
 
548 aa  425  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  42 
 
 
561 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  41.27 
 
 
561 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  39.08 
 
 
555 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  38.9 
 
 
555 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  39.67 
 
 
566 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0096  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 
550 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.458831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  37.64 
 
 
556 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  41.35 
 
 
550 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  39.93 
 
 
561 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  37.27 
 
 
556 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  37.27 
 
 
556 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  37.27 
 
 
556 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 
583 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  38.07 
 
 
553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  38.26 
 
 
561 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  37.27 
 
 
556 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  37.27 
 
 
556 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  37.45 
 
 
556 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  37.27 
 
 
556 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 
556 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  37.27 
 
 
556 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  41.3 
 
 
546 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  41.12 
 
 
546 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  41.05 
 
 
561 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  38.3 
 
 
561 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  36.65 
 
 
569 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  40.15 
 
 
561 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 
561 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.07 
 
 
561 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  40.11 
 
 
566 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.89 
 
 
555 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  39.42 
 
 
561 aa  395  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  38.55 
 
 
547 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  39.27 
 
 
595 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  39.08 
 
 
565 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 
559 aa  395  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 
561 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  36.56 
 
 
557 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  39.74 
 
 
561 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  37.43 
 
 
552 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 
580 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  39.71 
 
 
561 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  37.28 
 
 
556 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  37.29 
 
 
563 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>