136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0808 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1136  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  69.04 
 
 
520 aa  764    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0808  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
519 aa  1063    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.276491  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2899  beta-lactamase domain protein  37.71 
 
 
529 aa  270  7e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.920708  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1034  hypothetical protein  35.4 
 
 
519 aa  254  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000166295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0266  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  31.77 
 
 
522 aa  196  6e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0268  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  31.58 
 
 
522 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2046  hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily-like  26.77 
 
 
437 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.419381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2421  beta-lactamase domain protein  24.95 
 
 
430 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2888  beta-lactamase domain-containing protein  24.14 
 
 
429 aa  100  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3639  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 
428 aa  88.6  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0859  beta-lactamase domain-containing protein  23.26 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0698444  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0260  beta-lactamase domain-containing protein  23 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1639  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24.16 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000492712  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  22.22 
 
 
555 aa  70.5  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15520  beta-lactamase domain protein  23.59 
 
 
556 aa  70.5  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 
557 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3305  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
423 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1170  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  23.37 
 
 
591 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.811184  hitchhiker  0.000000000000102391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  22.57 
 
 
554 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 
558 aa  65.1  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  24.83 
 
 
556 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 
554 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  23.08 
 
 
553 aa  63.9  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  24.83 
 
 
558 aa  63.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.08 
 
 
557 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  25.08 
 
 
557 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0021  beta-lactamase domain protein  21.35 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  23.13 
 
 
440 aa  60.5  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  21.49 
 
 
561 aa  60.1  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  23.8 
 
 
556 aa  60.1  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  21.32 
 
 
555 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  22.15 
 
 
547 aa  58.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  20.58 
 
 
560 aa  57.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  24.84 
 
 
554 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0864  beta-lactamase domain protein  22.25 
 
 
552 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.412848  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  21.34 
 
 
540 aa  55.8  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4720  beta-lactamase domain protein  24.33 
 
 
416 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.209873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24.36 
 
 
557 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  22.18 
 
 
572 aa  54.7  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2106  beta-lactamase domain-containing protein  25.39 
 
 
554 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  24.79 
 
 
468 aa  54.7  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  22.62 
 
 
583 aa  54.7  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  23.76 
 
 
561 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  21.66 
 
 
558 aa  53.9  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  21.7 
 
 
552 aa  54.3  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  24.5 
 
 
558 aa  53.9  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  24.5 
 
 
558 aa  53.9  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  22.49 
 
 
550 aa  53.9  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  21.84 
 
 
558 aa  53.5  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 
428 aa  53.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 
553 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  23.6 
 
 
544 aa  52.8  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 
556 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  23.1 
 
 
564 aa  51.2  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  31.13 
 
 
556 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf128  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.03 
 
 
594 aa  51.2  0.00004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1887  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  19.81 
 
 
717 aa  50.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.441469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  22.75 
 
 
546 aa  50.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  21.84 
 
 
554 aa  50.8  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl570  putative metallo-beta lactamase hydrolase  21.38 
 
 
588 aa  50.1  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00258207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  22.6 
 
 
558 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  23.31 
 
 
542 aa  49.7  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  21.83 
 
 
558 aa  49.7  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  23.12 
 
 
421 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  20 
 
 
573 aa  49.7  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2452  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 
547 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654056  normal  0.754885 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  21 
 
 
553 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22 
 
 
561 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  22.01 
 
 
556 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  24.55 
 
 
454 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.98 
 
 
557 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  21.82 
 
 
550 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  22.01 
 
 
556 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 
553 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  22.65 
 
 
557 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  25.43 
 
 
557 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  23.99 
 
 
558 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 
557 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  24.29 
 
 
556 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  21.77 
 
 
556 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  22.65 
 
 
557 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  21.77 
 
 
556 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  21.77 
 
 
556 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  21.77 
 
 
556 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  21.77 
 
 
556 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  21.77 
 
 
556 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 
554 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3999  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 
558 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.818404  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.65 
 
 
557 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  20.96 
 
 
618 aa  48.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  21.77 
 
 
556 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  21.77 
 
 
556 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  22.9 
 
 
557 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0649  beta-lactamase domain-containing protein  21.52 
 
 
593 aa  47.8  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000403625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 
564 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  22.4 
 
 
557 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  25.12 
 
 
563 aa  47.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  22.11 
 
 
544 aa  47.4  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  21.79 
 
 
821 aa  47.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0306  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  19.9 
 
 
635 aa  47  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>