195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1639 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1639  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 
433 aa  885    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000492712  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2046  hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily-like  29.07 
 
 
437 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.419381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2421  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 
430 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0260  beta-lactamase domain-containing protein  21.89 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4720  beta-lactamase domain protein  23.18 
 
 
416 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.209873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3305  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3639  beta-lactamase domain-containing protein  22.13 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0808  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 
519 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.276491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2888  beta-lactamase domain-containing protein  20.99 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  21.95 
 
 
551 aa  70.5  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  21.72 
 
 
551 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0859  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0698444  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.79 
 
 
557 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  23.14 
 
 
618 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  23.04 
 
 
557 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1034  hypothetical protein  21.9 
 
 
519 aa  67.4  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000166295  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  21.49 
 
 
551 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2899  beta-lactamase domain protein  21.85 
 
 
529 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.920708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  22.79 
 
 
557 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  23.02 
 
 
557 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  22.83 
 
 
554 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  23.11 
 
 
677 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  23.22 
 
 
557 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.79 
 
 
557 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 
555 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  24.37 
 
 
557 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  25.2 
 
 
556 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  22.56 
 
 
557 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  22.54 
 
 
644 aa  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24.56 
 
 
557 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  24.47 
 
 
556 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1136  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.66 
 
 
520 aa  63.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  23.98 
 
 
645 aa  63.5  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  23.42 
 
 
548 aa  63.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 
558 aa  62.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 
558 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  24.66 
 
 
652 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_2719  predicted protein  23.89 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127667  hitchhiker  0.00814758 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  22.74 
 
 
631 aa  62  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  23.82 
 
 
556 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  22.52 
 
 
554 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  23.84 
 
 
590 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  22.7 
 
 
566 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  23.74 
 
 
555 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 
558 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 
548 aa  60.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0021  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
422 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  22.4 
 
 
561 aa  60.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15520  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 
556 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  22.62 
 
 
557 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  22.41 
 
 
554 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1636  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 
448 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  23.43 
 
 
553 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  24.1 
 
 
556 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  22.58 
 
 
554 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0063  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 
664 aa  59.3  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  20.55 
 
 
554 aa  58.9  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  21.97 
 
 
558 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0905  beta-lactamase domain-containing protein  23.61 
 
 
448 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  23.01 
 
 
555 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  24.59 
 
 
556 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  23.7 
 
 
553 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1185  beta-lactamase domain-containing protein  22.25 
 
 
448 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1041  beta-lactamase domain-containing protein  23.38 
 
 
448 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.467823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 
556 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  21.89 
 
 
554 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  28.26 
 
 
813 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0950  putative metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  21.85 
 
 
616 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  24.21 
 
 
662 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  22.85 
 
 
550 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  21.15 
 
 
555 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1059  beta-lactamase domain-containing protein  23.15 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0864  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 
552 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.412848  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  23.18 
 
 
556 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  22.87 
 
 
555 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  21.67 
 
 
572 aa  54.7  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  21.79 
 
 
561 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  23.53 
 
 
662 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0268  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  22.86 
 
 
522 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  23.3 
 
 
555 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  23.53 
 
 
662 aa  53.9  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2016  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  23.85 
 
 
578 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0968063  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  21.55 
 
 
555 aa  53.5  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  21.25 
 
 
553 aa  53.1  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2089  hypothetical protein  21.81 
 
 
647 aa  53.1  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  24.42 
 
 
550 aa  53.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  23.82 
 
 
557 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  23.26 
 
 
555 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  22.03 
 
 
549 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.76 
 
 
555 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  21.25 
 
 
556 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  22.45 
 
 
563 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0266  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  22.49 
 
 
522 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  21.63 
 
 
558 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  21.33 
 
 
559 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  23.23 
 
 
573 aa  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  22.79 
 
 
542 aa  51.2  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 
830 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2106  beta-lactamase domain-containing protein  22.54 
 
 
554 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>