212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0260 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0260  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 441 aa  915    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0021  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 422 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4720  beta-lactamase domain protein  34.16 
 
 		 416 aa  236  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.209873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3305  beta-lactamase domain protein  35.93 
 
 		 423 aa  234  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0859  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 414 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0698444  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3639  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2046  hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily-like  24.24 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.419381  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2899  beta-lactamase domain protein  24.53 
 
 		 529 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.920708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1136  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.13 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2421  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 		 430 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1639  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  21.89 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000492712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  23.54 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 		 555 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0808  beta-lactamase domain-containing protein  23 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.276491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 557 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  24.21 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  24.55 
 
 		 555 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.75 
 
 		 557 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  23.62 
 
 		 548 aa  70.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  25.47 
 
 		 555 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  22.17 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1034  hypothetical protein  33.83 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000166295  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.81 
 
 		 558 aa  68.9  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 556 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 590 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 557 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  22.75 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 557 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 556 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  27.45 
 
 		 555 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 		 650 aa  67  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  25.18 
 
 		 558 aa  67  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  27.86 
 
 		 644 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  22.72 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  24.05 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 557 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  24.05 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  24.05 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3999  beta-lactamase domain-containing protein  24.67 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.818404  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 		 556 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  25.67 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  22.22 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  26.94 
 
 		 560 aa  65.1  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  22.43 
 
 		 561 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  22.09 
 
 		 561 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 556 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15520  beta-lactamase domain protein  22.86 
 
 		 556 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  23.32 
 
 		 559 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  22.89 
 
 		 553 aa  63.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  22.37 
 
 		 565 aa  63.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  24.07 
 
 		 558 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2089  hypothetical protein  21.73 
 
 		 647 aa  63.2  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  24.27 
 
 		 556 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  21.95 
 
 		 554 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.28 
 
 		 561 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  23.87 
 
 		 562 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  21.13 
 
 		 548 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1727  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  20.09 
 
 		 570 aa  62  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1170  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  22.41 
 
 		 591 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.811184  hitchhiker  0.000000000000102391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  23.2 
 
 		 559 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  21.97 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  28.17 
 
 		 631 aa  62  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0268  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  22.05 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144597  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 546 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  22.22 
 
 		 561 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12765  hypothetical protein  23.76 
 
 		 558 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.868415 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0266  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  22.56 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  21.46 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  21.47 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  23.87 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  22.45 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  23.37 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  21.16 
 
 		 566 aa  60.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  22.62 
 
 		 546 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  22.2 
 
 		 556 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 		 568 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  21.49 
 
 		 550 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  24.17 
 
 		 560 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  29.08 
 
 		 556 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  22.34 
 
 		 544 aa  59.7  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0063  beta-lactamase domain protein  22.13 
 
 		 664 aa  59.3  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0950  beta-lactamase domain protein  21.43 
 
 		 619 aa  59.7  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  25.19 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  20.55 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0950  putative metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  26.22 
 
 		 616 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  21.56 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  22.22 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  20.51 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  22.35 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1150  hypothetical protein  25.84 
 
 		 675 aa  57.4  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.920604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 		 563 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  20.09 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_2719  predicted protein  21.99 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127667  hitchhiker  0.00814758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>