More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1727 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1186  metallo-beta-lactamase superfamily protein  61.12 
 
 
553 aa  683    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1727  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 
570 aa  1163    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1152  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  60.83 
 
 
553 aa  696    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0649  beta-lactamase domain-containing protein  51.23 
 
 
593 aa  594  1e-168  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000403625  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1170  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  50.6 
 
 
591 aa  578  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.811184  hitchhiker  0.000000000000102391 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0625  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  47.27 
 
 
609 aa  559  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1282  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  45.04 
 
 
636 aa  517  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1335  beta-lactamase domain-containing protein  42.44 
 
 
574 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.547881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1361  beta-lactamase domain-containing protein  42.44 
 
 
574 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 
583 aa  463  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  42.75 
 
 
556 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  42.21 
 
 
555 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0842  metallo-beta-lactamase family protein  41.71 
 
 
568 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  41.41 
 
 
551 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  41.09 
 
 
556 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  41.09 
 
 
556 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  41.09 
 
 
556 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  41.09 
 
 
556 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  41.09 
 
 
556 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  41.09 
 
 
556 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  40.55 
 
 
556 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  41.09 
 
 
556 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  41.09 
 
 
556 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  40.91 
 
 
556 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  39.64 
 
 
555 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  39.34 
 
 
555 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.34 
 
 
555 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  39.34 
 
 
555 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.34 
 
 
555 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.34 
 
 
555 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 
555 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  39.34 
 
 
555 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.34 
 
 
555 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.34 
 
 
555 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  39.45 
 
 
555 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  39.15 
 
 
555 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  39.38 
 
 
555 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 
555 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  39.53 
 
 
555 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  39.16 
 
 
566 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  40.44 
 
 
555 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  40.29 
 
 
554 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  37.73 
 
 
557 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  37.48 
 
 
557 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  37.3 
 
 
557 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  37.25 
 
 
557 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  37.54 
 
 
565 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.48 
 
 
557 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  37.54 
 
 
565 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 
559 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  38.41 
 
 
554 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  39.38 
 
 
554 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  40.07 
 
 
558 aa  405  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.3 
 
 
557 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  37.97 
 
 
560 aa  401  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.09 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.66 
 
 
557 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.3 
 
 
557 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  39.24 
 
 
560 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  38.22 
 
 
555 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  38.8 
 
 
555 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  37.82 
 
 
553 aa  395  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  38.29 
 
 
553 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  37.04 
 
 
560 aa  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  38.88 
 
 
554 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 
557 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
618 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  37.84 
 
 
555 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.74 
 
 
559 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  35.82 
 
 
561 aa  375  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  36.43 
 
 
551 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  35.44 
 
 
560 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  36.43 
 
 
551 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  36.43 
 
 
551 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  36.56 
 
 
553 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  35.39 
 
 
558 aa  359  9e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  34.66 
 
 
552 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 
557 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  34.84 
 
 
573 aa  357  2.9999999999999997e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  36.41 
 
 
560 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 
558 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
561 aa  347  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  34.99 
 
 
561 aa  345  8.999999999999999e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  34.79 
 
 
548 aa  343  5.999999999999999e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  33.03 
 
 
559 aa  340  4e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 
556 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  34.39 
 
 
533 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  35.03 
 
 
554 aa  337  3.9999999999999995e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 
569 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 
558 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  33.39 
 
 
558 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 
593 aa  330  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  33.27 
 
 
547 aa  329  9e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  36.09 
 
 
561 aa  325  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 
568 aa  323  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1516  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 
618 aa  321  3e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.09 
 
 
561 aa  319  7e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 
569 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  33.09 
 
 
561 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>