121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4089 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  47.22 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  44.27 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  41.23 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  36.03 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  35.8 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  35.83 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  33.07 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  33.21 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.66 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  34.57 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  36.33 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  35.95 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  35.63 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  31.47 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  33.85 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  33.07 
 
 		 796 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  30.38 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  28.34 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  28.98 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.86 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.88 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.12 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.12 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25.43 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.52 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.64 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.02 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.65 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  24.46 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  31.21 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  25.35 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  23.72 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  26.45 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  28.79 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  25.33 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  24.47 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  23.9 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  23.79 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  28.24 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  32.04 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 551 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  28.11 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_2719  predicted protein  24.14 
 
 		 413 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127667  hitchhiker  0.00814758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  25.68 
 
 		 607 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  27.6 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  20.85 
 
 		 315 aa  49.3  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  25.14 
 
 		 603 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  29.25 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  24.72 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  22.98 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  22.98 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  26.62 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  24.79 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  25.11 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 		 572 aa  46.6  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  23.46 
 
 		 338 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 395 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  22.86 
 
 		 298 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  26.51 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  22.77 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  23.11 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  25.77 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  25.26 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  26.58 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  26.38 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  23.23 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 566 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 		 552 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  24.69 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  22.31 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 		 559 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  25.86 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  25.86 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  27.04 
 
 		 310 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  30.84 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>