33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0338 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  100 
 
 		 339 aa  692    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  45.67 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  44.55 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  40.13 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  40.13 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  39.81 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  40.91 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  41.58 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  39.42 
 
 		 316 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  38.69 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  38.51 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  38.29 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84281  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase (PDEase) (3':5'-CNP)  28.94 
 
 		 384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.292629  normal  0.400104 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  27.98 
 
 		 561 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  29.41 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.36 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 252 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  24.52 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  25.99 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05390  cAMP-specific phosphodiesterase, putative  28.21 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  25.97 
 
 		 254 aa  53.9  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.3 
 
 		 255 aa  52.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.33 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.88 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  25.3 
 
 		 259 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  23.85 
 
 		 796 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  24.28 
 
 		 263 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  23.77 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>