94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0190 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 258 aa  520  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  60.77 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  55 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  54.17 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  51.34 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  43.85 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  43.85 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  43.7 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  41.54 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  43.93 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  40.23 
 
 		 256 aa  185  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  40.55 
 
 		 254 aa  185  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.89 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 		 252 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  39.67 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  38.19 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 		 252 aa  168  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  36.03 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 796 aa  135  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  28.97 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.44 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  27.54 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  27.4 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.88 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.88 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.88 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  29.39 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.32 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.49 
 
 		 329 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  24.56 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.75 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  25.34 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  22.87 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  43.28 
 
 		 561 aa  58.9  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  22.04 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  23.4 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  24.58 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  23.4 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  25.82 
 
 		 328 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25.72 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  24.09 
 
 		 308 aa  52.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  26.16 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  30.57 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  23.95 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1788  metallo-beta-lactamase family protein  23.9 
 
 		 419 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  37.25 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1565  zinc-dependent hydrolase  22.71 
 
 		 436 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 335 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  23.73 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  31.97 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 265 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  28.51 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  23.68 
 
 		 295 aa  48.5  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  25.2 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1574  Zn-dependent hydrolase  22.31 
 
 		 436 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000156356  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  24.15 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  31.25 
 
 		 306 aa  45.8  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1755  metallo-beta-lactamase family protein  23.05 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 821 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  28.48 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1613  metallo-beta-lactamase family protein  21.91 
 
 		 436 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  25.56 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3588  metallo-beta-lactamase family protein  22.58 
 
 		 419 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  33.7 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  25.91 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1737  metallo-beta-lactamase family protein  21.51 
 
 		 419 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0988  beta-lactamase domain protein  22.58 
 
 		 228 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  22.7 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 		 557 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  24.17 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0540  Ribonuclease Z  29.45 
 
 		 307 aa  42.4  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0647  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 		 551 aa  42.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.730868  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  36.84 
 
 		 813 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 		 309 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  42.67 
 
 		 308 aa  42  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1868  metallo-beta-lactamase family protein  21.98 
 
 		 419 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>