126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4676 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  100 
 
 		 263 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  77.57 
 
 		 263 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  67.17 
 
 		 267 aa  351  7e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  55 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  50 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  50.21 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  50.21 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  47.97 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  42.48 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  44.96 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  43.4 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  39.5 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  41.6 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  38.4 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  37.44 
 
 		 796 aa  154  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  36.33 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  37.35 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  29.58 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  29.05 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  39.83 
 
 		 561 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.7 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.81 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  28.26 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25.99 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.99 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  25.14 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  35.43 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  22.95 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  24.72 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  29.78 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3913  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25.64 
 
 		 330 aa  52.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  29.78 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  30 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  29.78 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  29.78 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  29.78 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  29.68 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.37 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  28.41 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  29.78 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.79 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  29.21 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  24.55 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  24.51 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  25.49 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25.75 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.33 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  25 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.47 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3827  hypothetical protein  27.33 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  21.04 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  23.76 
 
 		 422 aa  46.6  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09800  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.41 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.559051 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  39.74 
 
 		 454 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  27.75 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  30.52 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  24.72 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0562  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  28.65 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 		 309 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 289 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  25.82 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 454 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 452 aa  45.8  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 454 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2593  cyclic nucleotide-binding protein  24.62 
 
 		 707 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  28.85 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0988  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02190  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 		 549 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.464356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  24.11 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  23.47 
 
 		 421 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  22.03 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  26.39 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0893  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0178503  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  39.74 
 
 		 454 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84281  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase (PDEase) (3':5'-CNP)  33.96 
 
 		 384 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.292629  normal  0.400104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  31.86 
 
 		 331 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.664246 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>