34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1113 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  99.42 
 
 		 345 aa  701    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  100 
 
 		 345 aa  705    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  99.71 
 
 		 345 aa  703    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  64.11 
 
 		 326 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  54.66 
 
 		 329 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  46.22 
 
 		 330 aa  289  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.99 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  39.08 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  38.8 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  38.34 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.06 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  37.38 
 
 		 327 aa  215  9e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84281  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase (PDEase) (3':5'-CNP)  32.68 
 
 		 384 aa  116  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.292629  normal  0.400104 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  27.16 
 
 		 561 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  29.14 
 
 		 256 aa  87.4  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  27.45 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05390  cAMP-specific phosphodiesterase, putative  22.86 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.51 
 
 		 255 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  25.43 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.53 
 
 		 267 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  24.57 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  23.71 
 
 		 252 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  26.22 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.81 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  22.5 
 
 		 796 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  24.49 
 
 		 254 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.28 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  23.36 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.91 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  24.03 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>