116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09800 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09800  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  100 
 
 		 266 aa  556  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.559051 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  26.85 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.19 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  23.34 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  23.81 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  23.9 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  24.66 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  26.93 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  24.57 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  24.21 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  24.22 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23.77 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  25.25 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1128  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 		 327 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  22.3 
 
 		 323 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  24.17 
 
 		 324 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  25.7 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  25.54 
 
 		 326 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  27.84 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  22.73 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  23.55 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  23.33 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2918  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  22.79 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  22.97 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  25.47 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  25.47 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  23.02 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  25.53 
 
 		 364 aa  49.3  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  23.05 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  28.44 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0540  Ribonuclease Z  29.41 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  23.83 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  27.52 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  43.14 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  46.88 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  23.81 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  23.81 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  23.81 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  26.5 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  29.41 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  38.81 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  23.86 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  23.76 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.45 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  22.86 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  24.73 
 
 		 345 aa  45.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  28.42 
 
 		 285 aa  45.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  38.81 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  28.87 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  30.56 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  22.9 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  25.85 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  23.45 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  22.26 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  22.95 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  37.31 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 		 395 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  23.79 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  34.78 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  24.82 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  24.81 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  29.47 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.76 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  24.73 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  24.73 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2125  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.56 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1944  Beta-lactamase-like  32.53 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  38.6 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1735  cyclic nucleotide-binding protein  39.13 
 
 		 739 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00308523 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  26.89 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  24.38 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  24 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2932  metallo-beta-lactamase family protein  36.47 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2615  metallo-beta-lactamase family protein  36.47 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  35.09 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2334  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.577131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  24.38 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  23.03 
 
 		 313 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>