20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1735 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1735  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 739 aa  1532    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00308523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  50.96 
 
 		 871 aa  764    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2593  cyclic nucleotide-binding protein  24.46 
 
 		 707 aa  65.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  36.11 
 
 		 308 aa  50.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  39.66 
 
 		 327 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0184  beta-lactamase superfamily hydrolase  37.93 
 
 		 265 aa  48.5  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0942  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 267 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44387  predicted protein  28.3 
 
 		 1343 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 		 243 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  23.55 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  25.91 
 
 		 1040 aa  46.6  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  37.33 
 
 		 255 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 		 212 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  27.52 
 
 		 305 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  33.82 
 
 		 320 aa  44.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  27.52 
 
 		 318 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  34.25 
 
 		 300 aa  44.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 		 243 aa  44.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  23.15 
 
 		 253 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  32.86 
 
 		 286 aa  44.3  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>