225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3277 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  64.82 
 
 
253 aa  348  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  58 
 
 
254 aa  333  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  56.18 
 
 
254 aa  305  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  51.57 
 
 
254 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  51.97 
 
 
253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  49.81 
 
 
270 aa  265  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  51.37 
 
 
254 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  44.49 
 
 
252 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  44.49 
 
 
286 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  41.96 
 
 
260 aa  221  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  44.66 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  39.37 
 
 
264 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  38.49 
 
 
252 aa  206  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 
252 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  38.82 
 
 
255 aa  206  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  38.58 
 
 
251 aa  205  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  38.58 
 
 
255 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  40.71 
 
 
492 aa  199  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  40.55 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  38.19 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  40.55 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  39.92 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  40.94 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  37.6 
 
 
255 aa  194  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 
253 aa  191  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  37.94 
 
 
251 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  37.15 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  37.01 
 
 
253 aa  183  3e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 
261 aa  177  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 
272 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 
259 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  34.6 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  34.6 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  35.09 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  34.75 
 
 
265 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  32.95 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  32.82 
 
 
265 aa  144  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  35 
 
 
254 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 
265 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  32.22 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  32.18 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  34.11 
 
 
265 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  33.2 
 
 
265 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  34.11 
 
 
265 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 
269 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  29.26 
 
 
272 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  29.26 
 
 
272 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  31.92 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  32.71 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
274 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  29.28 
 
 
267 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  30.62 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  30.19 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  28.3 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  29.81 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 
254 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  28.52 
 
 
267 aa  126  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  30.04 
 
 
264 aa  125  5e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  29.81 
 
 
265 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  28.2 
 
 
268 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  31.32 
 
 
267 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  27.65 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  31.5 
 
 
269 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  28.3 
 
 
266 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  33.89 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  28.41 
 
 
268 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 
268 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  34.09 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  32.21 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  31.7 
 
 
245 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  28.27 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  26.77 
 
 
272 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  34.45 
 
 
239 aa  106  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 
242 aa  102  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  31.91 
 
 
240 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
240 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  45 
 
 
100 aa  96.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.68 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.73 
 
 
265 aa  95.1  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.48 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.48 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  34.17 
 
 
150 aa  89.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.81 
 
 
250 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.81 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  29.75 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.57 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.65 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.68 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.75 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  27.38 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>