210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1586 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
267 aa  535  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 
255 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 
255 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  31.73 
 
 
264 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 
251 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 
261 aa  94.7  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 
251 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  30.71 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  27.11 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  31.39 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  32.35 
 
 
492 aa  88.6  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  27.54 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  35.02 
 
 
272 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 
252 aa  86.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  32.23 
 
 
252 aa  86.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  30.26 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  34.66 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  32.16 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  35.04 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  26.26 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  31.64 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 
274 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  27.5 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  35.13 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  31.99 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  35.13 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  32.85 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  32.04 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  34.55 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  31.62 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  29.45 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  29.45 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.36 
 
 
257 aa  79  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 
254 aa  79  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  31.56 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  31.23 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  27.97 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  30.14 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.6 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.48 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.37 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.37 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  27.27 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.3 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  27.68 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.18 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.77 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  32.04 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.05 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.77 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  31.21 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  29.05 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.77 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  31.45 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  26.67 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  27.4 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.52 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  29.23 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  28.22 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.2 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.3 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  31.96 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.61 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 
265 aa  63.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0734  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  29.47 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>