201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3063 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  58.17 
 
 		 254 aa  323  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  56.52 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  56.18 
 
 		 253 aa  305  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  55.38 
 
 		 253 aa  295  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  53.97 
 
 		 253 aa  274  9e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  53.36 
 
 		 254 aa  267  8.999999999999999e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  44.14 
 
 		 270 aa  245  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  42.46 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  42.69 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  48.02 
 
 		 253 aa  224  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  41.11 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  40.32 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  40.78 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  44.05 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  37.94 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  41.34 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  41.34 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  42.06 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  37.7 
 
 		 264 aa  201  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  39.36 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  38.49 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  41.27 
 
 		 492 aa  194  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  41.34 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  36.65 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  35.97 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  35.16 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  37.84 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  35.88 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  35.58 
 
 		 272 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  35.5 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  35.5 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  32.95 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  33.84 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  33.21 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  29.89 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  31.62 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  30.94 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  30.94 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  32.18 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 271 aa  143  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  32.18 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  31.09 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  31.09 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  30.97 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  29.06 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  28.9 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  29.7 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  29.01 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  29.89 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  28.46 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  29.55 
 
 		 266 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  30.42 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  31.85 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  28.14 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  28.52 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  30.27 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 265 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  26.82 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  30.08 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  27.2 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  30.86 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  28.96 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  47 
 
 		 100 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  29.03 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  25.27 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.61 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.61 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 		 270 aa  92  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  36.15 
 
 		 150 aa  89.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  26.69 
 
 		 240 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.94 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.94 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.24 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  36.75 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  27.84 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.72 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.72 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.72 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  25.28 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>