195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0013 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 253 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  64.82 
 
 		 253 aa  348  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  58.89 
 
 		 254 aa  330  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  56.8 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  55.38 
 
 		 254 aa  295  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  52.76 
 
 		 253 aa  275  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  53.36 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  45.7 
 
 		 270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  47.43 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  44.09 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  42.06 
 
 		 492 aa  208  6e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 252 aa  205  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  38.82 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  39.37 
 
 		 255 aa  201  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  41.57 
 
 		 252 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  41.57 
 
 		 252 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  43.31 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  40.16 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  37.01 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  36.22 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  37.15 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  36.61 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  36.68 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  35.57 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  35.83 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  35.34 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  35.83 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  38.29 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  37.97 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  36.94 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  36.94 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  36.36 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  36.36 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  36.12 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  34.23 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  33.98 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  34.09 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  34.1 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  31.56 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  32.96 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  30.08 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  29.66 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  32.45 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  32.83 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 269 aa  131  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  30.86 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  30.8 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  30.57 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 		 262 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  30.34 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  29.59 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  29.59 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  27.76 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  31.32 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  31.18 
 
 		 266 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  30.57 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  33.71 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  34.6 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  29.1 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  27.68 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  28.41 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  49 
 
 		 100 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  31.44 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.27 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 		 239 aa  99.8  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  30.17 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.85 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.41 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  35.19 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  30.83 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  36.24 
 
 		 150 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.06 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.06 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.25 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.25 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.56 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.17 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 274 aa  88.6  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.79 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.3 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>