127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1532 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 265 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  73.48 
 
 		 265 aa  401  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  56.23 
 
 		 267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  54.72 
 
 		 267 aa  321  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  54.34 
 
 		 265 aa  317  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  56.7 
 
 		 268 aa  308  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  54.72 
 
 		 266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  57.69 
 
 		 265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  55.34 
 
 		 269 aa  305  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  56.6 
 
 		 272 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  56.6 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  51.7 
 
 		 270 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  57.92 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  53.61 
 
 		 266 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  53.26 
 
 		 265 aa  292  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  52.08 
 
 		 267 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  56.11 
 
 		 269 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  53.49 
 
 		 265 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  53.49 
 
 		 265 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  55.17 
 
 		 267 aa  285  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  53.1 
 
 		 265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  48.47 
 
 		 272 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  48.47 
 
 		 272 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  50 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  49.62 
 
 		 284 aa  278  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  48.09 
 
 		 272 aa  278  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  48.85 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  47.71 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  48.85 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  51.54 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  47.71 
 
 		 271 aa  258  8e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  45.9 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  47.73 
 
 		 268 aa  252  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  41.64 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  41.54 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  41.22 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  39.62 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  37.12 
 
 		 252 aa  185  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  40.22 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  37.83 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  36.98 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  36.12 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  39.31 
 
 		 255 aa  178  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  37.45 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  38.85 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  36.15 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  36.15 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  36.8 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  39.85 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  35.09 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  35.77 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  34.96 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  37.17 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 		 253 aa  145  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  34.93 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  31.3 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  33.71 
 
 		 492 aa  139  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  29.28 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  28.41 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  45.63 
 
 		 100 aa  95.5  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  32.16 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.71 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.71 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  29.15 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  31.2 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  23.53 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  24.81 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.58 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  33.61 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  24.46 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.59 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.54 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.24 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.27 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.54 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.64 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.93 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.37 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  26.79 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.77 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>