107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3115 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  55.19 
 
 		 284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  55.19 
 
 		 268 aa  293  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  52.03 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  49.63 
 
 		 265 aa  285  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  50 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  50.19 
 
 		 265 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  51.67 
 
 		 266 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  50.19 
 
 		 265 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  51.3 
 
 		 265 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  50 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  50 
 
 		 267 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  49.82 
 
 		 267 aa  271  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  51.12 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  49.45 
 
 		 265 aa  268  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  52.99 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  49.45 
 
 		 267 aa  266  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  52.31 
 
 		 268 aa  265  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  50.19 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  47.23 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  51.32 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  50.57 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  51.32 
 
 		 269 aa  255  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  50.37 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  50.19 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  48.9 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  45.93 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  46.44 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  46.44 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  46.99 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  45.93 
 
 		 272 aa  242  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  44.98 
 
 		 272 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  45.19 
 
 		 274 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  44.81 
 
 		 274 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  42.16 
 
 		 271 aa  221  9e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  43.22 
 
 		 254 aa  208  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  41.11 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  40.81 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  38.75 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  39.03 
 
 		 255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  38.66 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  38.66 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  34.46 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  40.74 
 
 		 255 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  37 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  36.67 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  35.45 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  32.96 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  36.4 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  31.64 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  34.7 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  31.99 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 254 aa  129  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  32.01 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  31.5 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  32.25 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  25.47 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  28.84 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  28.84 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  27.88 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  30.74 
 
 		 492 aa  113  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  27.74 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  42.45 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  32.24 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  26.79 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  25.63 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  26.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  38.78 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  26.4 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  25.09 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  25.39 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  27.49 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.57 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.04 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.04 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.87 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.87 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 		 242 aa  48.9  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 		 480 aa  48.9  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.8 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.57 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  24.46 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  24.11 
 
 		 252 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>