204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2465 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 251 aa  508  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  77.69 
 
 		 264 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  73.31 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  71.71 
 
 		 251 aa  362  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  69.72 
 
 		 251 aa  355  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  63.75 
 
 		 255 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  61.35 
 
 		 253 aa  315  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  52.78 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  45.2 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  46.03 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  46.03 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  42.46 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  41.57 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  42.58 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  44.84 
 
 		 252 aa  218  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  37.8 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  44.88 
 
 		 255 aa  210  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  41.11 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  41.86 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  38.49 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  43.43 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  39.92 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  41.11 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  43.56 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  42.53 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  37.65 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  41.98 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  39.54 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  41.67 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  37.4 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  40.75 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  43.89 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  38.78 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  38.4 
 
 		 267 aa  184  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  39.23 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  39.38 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  39.23 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  40.71 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  39.85 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  37.4 
 
 		 271 aa  181  9.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  41.86 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  39.54 
 
 		 268 aa  178  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  39.1 
 
 		 268 aa  178  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  38.61 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  35.98 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  37.98 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  39.33 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  37.4 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  39.33 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  43.25 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  41.76 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  42.42 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  36.4 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  37.07 
 
 		 272 aa  165  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  37.07 
 
 		 272 aa  165  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.68 
 
 		 492 aa  164  9e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  35.36 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  38.78 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  37.26 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  35.85 
 
 		 263 aa  158  6e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  34.35 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  36.98 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  36.96 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  32.85 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  36.02 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  35.83 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  33.89 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  56.57 
 
 		 100 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  33.89 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  31.54 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  30.65 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  29.7 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.62 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.54 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.18 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.18 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.68 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.42 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  31.18 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  27.19 
 
 		 372 aa  93.2  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  38.78 
 
 		 150 aa  92.4  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  33.33 
 
 		 265 aa  92  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  30.15 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.94 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  27.99 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>