131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1585 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  100 
 
 
272 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  65.4 
 
 
272 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1800  beta-lactamase domain protein  64.04 
 
 
274 aa  357  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0131454  normal  0.0301094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1288  beta-lactamase domain-containing protein  62.96 
 
 
284 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.263316  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  62.36 
 
 
272 aa  353  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  62.36 
 
 
272 aa  353  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1988  beta-lactamase domain protein  62.92 
 
 
274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.885217  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2160  metal dependent hydrolase  64.26 
 
 
272 aa  352  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0818  metallo-beta-lactamase family protein  58.36 
 
 
271 aa  345  5e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.274657  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  51.71 
 
 
266 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  50.57 
 
 
267 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  50.76 
 
 
267 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  53.01 
 
 
265 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  50.38 
 
 
267 aa  275  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  52.65 
 
 
265 aa  275  8e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4098  hypothetical protein  51.71 
 
 
265 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0230981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  47.71 
 
 
265 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  49.81 
 
 
266 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0539  beta-lactamase domain protein  50.96 
 
 
265 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  48.12 
 
 
270 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
269 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  50.38 
 
 
265 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  52.67 
 
 
268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1516  beta-lactamase domain-containing protein  50.19 
 
 
267 aa  250  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  50 
 
 
265 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  50 
 
 
265 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  49.81 
 
 
266 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  48.86 
 
 
268 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4389  beta-lactamase domain-containing protein  47.92 
 
 
269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  48.51 
 
 
272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3115  beta-lactamase-like protein  45.93 
 
 
272 aa  242  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402166  normal  0.647891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  48.51 
 
 
272 aa  241  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2696  hypothetical protein  45.56 
 
 
268 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0186749  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  49.25 
 
 
269 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1451  beta-lactamase-like protein  43.45 
 
 
284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.935768  hitchhiker  0.000511853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  43.07 
 
 
267 aa  211  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 
254 aa  205  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  42.97 
 
 
252 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  42.97 
 
 
252 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  38.26 
 
 
253 aa  199  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  40.67 
 
 
255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0907  beta-lactamase domain-containing protein  40.66 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0676243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  38.02 
 
 
255 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  41.73 
 
 
262 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  38.43 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  35.88 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  36.4 
 
 
252 aa  182  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  35.77 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 
253 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  34.85 
 
 
251 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  39.54 
 
 
252 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  34.98 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  36.94 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  36.36 
 
 
253 aa  172  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  37.08 
 
 
255 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  38.26 
 
 
251 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  34.08 
 
 
286 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  38.02 
 
 
251 aa  168  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 
254 aa  168  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  38.29 
 
 
253 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  35.58 
 
 
254 aa  165  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  33.71 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  35.98 
 
 
251 aa  161  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  34.98 
 
 
253 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  39.1 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 
263 aa  152  8e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 
254 aa  151  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  35.09 
 
 
253 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  33.7 
 
 
264 aa  149  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  32.95 
 
 
492 aa  138  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  31 
 
 
259 aa  122  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 
270 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0659  hydrolase, metal-dependent, putative  29.21 
 
 
266 aa  100  3e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  48 
 
 
100 aa  96.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  32.85 
 
 
372 aa  96.3  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  31.64 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  28.12 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1487  putative hydrolase protein  37.7 
 
 
150 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010251  normal  0.184019 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  26.09 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  26.95 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.64 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.64 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  26.25 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01800  conserved hypothetical protein  29.23 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00595341  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.83 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.68 
 
 
254 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.74 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.76 
 
 
256 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.34 
 
 
258 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  28.99 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.79 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.71 
 
 
255 aa  58.9  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>