206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2524 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  100 
 
 		 258 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  68.13 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  68.13 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  65.86 
 
 		 255 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.91 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  57.32 
 
 		 251 aa  301  9e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.42 
 
 		 261 aa  295  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.42 
 
 		 261 aa  295  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.81 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  54.55 
 
 		 249 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.8 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.8 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.8 
 
 		 250 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  51.91 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.77 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  55.41 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.05 
 
 		 252 aa  225  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  51.91 
 
 		 254 aa  225  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.77 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.52 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.87 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.32 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  49.32 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  49.32 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.87 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4646  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.42 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.12 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  49.78 
 
 		 249 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  45.34 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.62 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  48.05 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  45.22 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  39.56 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  30.97 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  28.2 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  27.99 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  29.74 
 
 		 239 aa  88.6  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  27.87 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  28.98 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  25.1 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  27.57 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  26.81 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  27.57 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  29.96 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  30.42 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  26.71 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  27.2 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  30.31 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  30.31 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  25.2 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  30.59 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  28.21 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  28.35 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  27.34 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  28.4 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  27.85 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1139  Beta-lactamase-like  34.39 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000269692  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  27.34 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 		 242 aa  62  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  27.82 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0919  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  28.4 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  26.82 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  28.02 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1496  putative hydrolase protein  39.13 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.51917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  30.95 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  26.82 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  26.3 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  24.45 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  27.82 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  27.95 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  28.85 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>