226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2288 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  100 
 
 		 255 aa  522  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2524  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  65.86 
 
 		 258 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  60.8 
 
 		 251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  62.4 
 
 		 260 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  62.4 
 
 		 260 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  59.2 
 
 		 251 aa  316  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4045  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.05 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0225  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.05 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2567  phosphonate metabolism protein, PhnP  55.2 
 
 		 249 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0979832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.4 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  51 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.6 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.6 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.01 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  56.4 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.62 
 
 		 252 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  50.21 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  50.21 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  50.21 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1757  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  53.54 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20450  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.36 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.214049  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.38 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3684  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.02 
 
 		 255 aa  245  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  52.36 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.38 
 
 		 252 aa  241  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4646  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  48.97 
 
 		 252 aa  241  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  47.58 
 
 		 255 aa  241  9e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  46.8 
 
 		 252 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0583  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.59 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  49.2 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  50 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0487  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  49.17 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  31.76 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  29.43 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  32.47 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  27.27 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 261 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  25.9 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  25.1 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  28.15 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  25.38 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  27.17 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  28.41 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0580  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  27.35 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  27.65 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  25.2 
 
 		 253 aa  72  0.000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  30.58 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  26.87 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  29.01 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  26.54 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  24.05 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1586  beta-lactamase-like protein  29.2 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  23.99 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  28.94 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  28.94 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  28.26 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3594  beta-lactamase-like  27.27 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.545282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1460  hypothetical protein  27.17 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1699  Beta-lactamase-like  27.31 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3434  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  26.71 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  27.17 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4701  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0311936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  27.17 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  26.98 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47617  predicted protein  25.6 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  26.34 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  29.46 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6919  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>